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R语言机器学习算法实战系列(五)GBM算法+SHAP值 (Gra

R语言机器学习算法实战系列(五)GBM算法+SHAP值 (Gra

作者: 生信学习者2 | 来源:发表于2024-10-18 08:58 被阅读0次
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介绍

Gradient Boosting Machines(GBM)是一种集成学习算法,它通过构建多个弱预测模型(通常是决策树),然后将这些模型的预测结果组合起来,以提高预测的准确性。GBM的核心思想是逐步添加模型,每个新模型都尝试纠正前一个模型的错误。

算法原理:

  1. 初始化模型: 首先,GBM从一个初始模型开始,这个模型可以是一个简单的模型,比如一个常数值(回归问题)或一个简单的分类器(分类问题)。
  2. 负梯度方向: 对于每个训练样本,计算当前模型的预测值与真实值之间的残差(或误差)。在回归问题中,这通常是真实值与预测值之间的差;在分类问题中,这可能是梯度(在某些实现中,如AdaBoost)或二阶导数(即Hessian,用于提升树模型)。
  3. 构建决策树: 然后,GBM会构建一个新的决策树,这个树的目标是最小化残差(或误差)的加权和。这意味着新树将尝试预测那些当前模型预测错误的样本。
  4. 更新模型: 新构建的决策树会通过一个学习率(通常小于1)进行缩放,然后加到现有的模型上。学习率可以控制每棵树对最终预测的贡献,防止过拟合。
  5. 迭代过程: 重复步骤2-4,直到达到预定的迭代次数或模型的性能不再显著提升。
  6. 最终预测: 在训练完成后,GBM将所有构建的树的预测结果结合起来,形成最终的预测。在回归问题中,这通常是预测值的总和;在分类问题中,这可能是一个投票或平均过程。

步骤:

  1. 初始化: 设置初始模型,可以是简单的基线模型。
  2. 迭代: 对于每轮迭代:
    • 计算残差:对于每个训练样本,计算当前模型的预测值与真实值之间的残差。
    • 构建决策树:使用残差作为目标来训练一个新的决策树。
    • 更新模型:将新树的预测乘以学习率后加到现有模型上。
  3. 终止条件: 检查是否达到迭代次数或模型性能不再提升。
  4. 输出: 输出最终的集成模型,该模型是所有决策树的加权和。

教程

本文旨在通过R语言实现GBM,总共包含:

  1. 下载数据
  2. 加载R包
  3. 数据预处理
  4. 数据描述
  5. 数据切割
  6. 调节参数
  7. 构建模型
  8. 预测测试数据
  9. 评估模型
  10. 特征的重要性
  11. 模型SHAP值解释
  12. 保存模型
  13. 总结
  14. 系统信息

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