行上行下
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Hello,
这里是行上行下,我是喵君姐姐~
今天为大家介绍的是核磁的相关教程~
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*由于我们的精力有限,内容可能难免会有遗漏或错误,欢迎大家批评指正,提出宝贵建议,我们一起共同学习和进步~
Part 1
核磁教程
严超赣的视频
http://rfmri.org/Course
卢家峰的视频:
http://www.ym.edu.tw/~cflu
静息态数据(DPABISurf包)
http://rfmri.org/
磁共振之家
http://www.mrihome.com/portal.php
我爱脑科学
http://52brain.com/
CSDN-开发者社区
https://www.csdn.net/
Github获取文献影像处理代码及mask等
http://www.github.com
脑网络组谱图
http://atlas.brainnetome.org/index.html
弥散张量成像DTI
https://mp.weixin.qq.com/s/0IPK6OwAuDMj4qiPXBND8Q
Part 2
神经成像工具和资源的来源
NITRC
https://www.nitrc.org/
I Do Imaging
http://www.idoimaging.com/
Part 3
预处理
POWER分析
PowerMap software
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4426870/
fMRIPower tool
https://jeanettemumford.org/fmripower/
NeuroPower
http://neuropowertools.org/
减少伪影
Artifact detection Tool (ART)
http://www.nitrc.org/projects/artifact_detect/
PhysIOToolbox
https://www.nitrc.org/projects/physio/
ArtRepairSoftware
https://cibsr.stanford.edu/tools/human-brain-project/artrepair-software.html
FMRIB’s-based Xnoisifier (FIX)
http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FIX
RobustWLS Toolbox
http://www.diedrichsenlab.org/imaging/robustWLS_spm12.html
质控和数据格式转换
dcm2nii
https://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage
MRIConvert
https://lcni.uoregon.edu/downloads/mriconvert/mriconvert-and-mcverter
NiBabel
http://nipy.org/nibabel/index.html
空间标准化
"icbm2tal”(GingerALE)
http://www.brainmap.org/icbm2tal/
“mni2tal”(BioImageSuite)
https://bioimagesuiteweb.github.io/webapp/mni2tal.html
排版:昆昆
校对:喵君姐姐 华华
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