因为种间的基因流和共享祖先多态性,特别是维持平衡选择的存在,系统发育分析是复杂的。在这个研究中,我们的目的是检测在杨属中这些因素的情况。
基于重测序数据,我们构建了一个系统发育树,包含29个属80个物种。基因核基因组,我们的物种树分析揭示了杨属主要分为四个演化支,但是与质体基因组的进化树存在冲突。因为基因树的不一致,一些种间关系在多物种演化支中仍未解决。我们的结果指示,在每个支中存在广泛的基因流,在四个演化支的早期分化过程中也存在。
我们识别到45个候选基因受古老的多态性维持通过平衡选择。这些基因主要关联到一些交配亲和性、生长和抗逆性。
基因流和选择介导的古多态性在杨属中普遍存在。这些是适应性变异潜在的重要贡献者。我们的研究结果为模式树属的多样化提供了一个框架,这将有助于今后的比较研究。
文献来源:
Phylogenomics of the genus Populus reveals extensive interspecific gene flow and balancing selection
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