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单细胞基础知识补充4-设置工作空间setwd()

单细胞基础知识补充4-设置工作空间setwd()

作者: oceanandshore | 来源:发表于2022-08-03 15:28 被阅读0次

这个设置工作目录出错好几次了,今天解决一下

总结起来就是一句话:相对路径和绝对路径的区别。设置工作目录setwd() ,目录里面的都可以用,不设置就写绝对路径,但是麻烦容易出错,换电脑后不方便用原来代码。

当你用setwd的时候,能考虑一下Rproject的感受吗


R语言文件读取只有一个报错,就是:


image.png

传统的R语言书和课程里会讲,setwd()这个命令是设置工作目录用的,所谓工作目录就是图片导出、脚本保存、数据读取的默认位置,这都已经9012年了,自从有了Rproject之后这个命令就应该被废弃了!

关于Rproject,可能对新手来说不太好理解,就是一个.rproj后缀的文件,他的作用是:

.rproj文件在哪,那里就是工作目录!

如此一来,你要读取的文件放在和.rproj所在的文件夹下,需要读取文件时,不要手打,只需要打出双引号,然后直接按tab键,选择文件,而非复制文件名是不会出现如此报错的!

image.png

有人说,设置了工作目录也可能有一个问题,工作目录下面还有下一级文件夹,是不是不能用?当然不是!哈佛课程里提倡的工作目录管理是这样的:


image.png

如果你要读取的data文件夹下的"x8.csv"文件的话,只需要:

x = read.csv("data/x8.csv")
x

就这么简单!不需要写绝对路径,代码应该有复用性,绝对路径严重违背了这个价值观,换个电脑不久不能用了吗?

写到这里,如果你的老师是教的setwd,你还坚持非要用这个命令,那么还是有一个建议:用!t!a!b!
当你避免不了写绝对路径的时候,就看一下会返回绝对路径的命令是怎么写的:

getwd()
#[1] "D:/我的坚果云/实时备课/Day1-R/01-get_start"

结尾粘贴一下花花老师的R-project管理多个R工作目录

正常情况下关于工作目录的介绍是:
设置工作目录:setwd()
查看工作目录:getwd()
这样的话,只设置了一个工作目录。
当你有多个项目并行的话,全都在一个文件夹下,会显得比较乱,“你就会很lao火”。下面介绍如何并行多个项目,也就是多个工作目录。

1.新建project

打开Rstudio,请忽略我脚本窗口里的内容。


image.png

project是绑定文件夹的。弹出的窗口问你是新建一个文件夹还是使用已经存在的文件夹。我们以新建为例:


image.png
image.png
image.png

填好文件夹名后,(其实给文件夹命名了,也就等于给project命名了,二者同名)点击Create Project,就打开了一个新的session,不干扰你目前正在进行的项目噢。

2.打开Rproject

只用这一个方法打开Rstudio。那么下次再要打开这个项目时,只需要在文件夹中找到这个R project,双击打开即可。


image.png

从此管理多个项目不成问题咯。
打开这个项目后,用getwd()查看一下,就会发现你的工作目录就是Rproject所在的目录啦。
你用到的同一个项目的脚本/数据全都默认放在这里。


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