测试中。。。

前言

做事想问题，目的要明确，并且一定要着眼于未来， 云计算越来越火了，将来的服务器都会是云的形式，使用者完全不必管硬件系统等乱七八糟的事，希望那几台破服务器少出问题，我真心没有激情，精力去倒腾那些玩意！

现在docker是很好的东西，2013年开始的项目，前些年就知道，可惜没有重视，现在才发现它真心好！

centos 真的很稳定， ubuntu什么的太花哨，经常出问题，安装软件看似简单，实际bug太多，超级麻烦！也许适合专业人士使用吧。闻道有先后，术业有专攻，人的精力毕竟是有限的，我的专业是生物信息学，不是系统运维，要抓住问题的主要矛盾，时间花在刀刃上！

年纪大了越来越啰嗦！

docker 安装centos，并且配置

docker安装看这里

pull 和配置。

pull 后直接进去，都写在一个脚本里吧，以后好复制

#去docker hub上选一个喜欢的centos基础镜像，我感觉这个还不错！
docker run -it vergissberlin/centos-development:latest bash
#安装环境
#这个很大的，大概3G
yum -y group install  developer-workstation-environment
yum -y group install compat-libraries
#安装development tool
yum group install -y 'Development Tools'
yum install -y openssl-devel libcurl-devel
yum install  xml2
sudo yum install yum-axelget
#安装R
yum install -y  epel-release
yum install -y R
yum update -y && yum upgrade
#安装python
yum install -y python
yum install -y python-pip
yum install python34
yum install python34-pip
sudo yum install curl-devel

一些配置参考

常用R 包

题外话

install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("igraph/rigraph")
detach("package:devtools")
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
biocLite("org.Dr.eg.db", suppressUpdates=T)
biocLite("org.Mm.eg.db" , suppressUpdates=T)
biocLite("org.Hs.eg.db", suppressUpdates=T)
biocLite("clusterProfiler", suppressUpdates=T)
biocLite("Rgraphviz" ,suppressUpdates=T)
biocLite("DOSE", suppressUpdates=T)
biocLite("pathview", suppressUpdates=T)
biocLite("clusterProfiler", suppressUpdates=T)
source("http://bioconductor.org/workflows.R")
workflowInstall("rnaseqGene")

一些配置

#修改root
passwd
#创建用户
#修改系统时间
cp /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai /etc/localtime

容器 建立ssh

https://www.jianshu.com/p/9e4d50ddc57e

启动容器

docker run -it -p 10022:22 -p 8788:8787 -v /data2:/data2  --privileged  -v /sys/fs/cgroup:/sys/fs/cgroup:ro -v /tmp/$(mktemp -d):/run  --name centos_my_1125 local/c7-my-0125:latest
# /usr/sbin/init
#启动ssh
/usr/sbin/sshd 

docker run -it -p 22325:22 -p 8789:8787 -v /data2:/data2 
/usr/sbin/sshd 

容器保存

配置好后，记住容器ID b860117d5106，忘了也没关系，命令docker ps -a查看刚刚退出的容积id即可，保存这个容器变成镜像！

docker commit -m 'fix hisat2_jun2bed.py and unmask' -a 'Docker rnacocktail' 961bcbc2bc85 marghoob/rnacocktail:fixed

其中，-m 来指定提交的说明信息，跟我们使用的版本控制工具一样；-a 可以指定更新的用户信息；之后是用来创建镜像的容器的 ID；最后指定目标镜像的仓库名和 tag 信息。创建成功后会返回这个镜像的 ID 信息。

container 备份以及恢复

#先commit，保存container的快照成image
docker commit -m 'ubuntu for work 01/26' 6b5dd866787a local/ubuntu:work_0126
#save image
docker save -o ubuntu_work_0126.tar local/ubuntu:work_0126
#恢复就是load
docker load -i  ubuntu_work_0126.tar 
 

https://linux.cn/article-5967-1.html

参考的blog太多，我就不一一列举了，反正又不是发文章！
http://blog.51cto.com/welcomeweb/1735251