水中的垃圾（有机物）被腐生细菌分解成有毒物质氨，然后再被亚消化细菌转化成亚硝酸盐NO2，如果你现在放鱼的话因为没有硝化细菌，鱼儿的粪便分解出大量的有毒物质氨，因为没有硝化细菌不能被及时分解，就会导致鱼儿中毒然后死亡。
接着亚硝酸盐转化成硝酸盐，此时滤材中的硝化细菌大量繁殖，但是现在的NO3含量过高还是不能放鱼。这时候藻类因为NO3含量高所以会迅速成长，然后吸收N03到最后NO3含量过低导致藻类白化，此时不换水也可以养鱼。
此时刷活石，刷缸祛藻的目的是防止藻类变成垃圾进入水中，并且消除其它杂质。
但是即便是养水结束也不能一次性放入较多的鱼，要分批次下，因为新滤材一开始是没有消化细菌的，即便是养水结束后，硝化细菌也是平衡的，所以如果放入过多的鱼，垃圾太多导致硝化细菌不能及时分解有毒物质，就会导致鱼儿中毒死亡。少量多次放入可以让硝化细菌有一定的增殖和培养时间。
养水的目的是为了培养生物的过滤系统，所以无论养FOT还是LPS都一定要先养水。
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