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Rstudio使用

Rstudio使用

作者: 路人里的路人 | 来源:发表于2023-07-21 12:11 被阅读0次

1.Rstudio调节字体

Tools\Rightarrowglobal options\RightarrowAppearance\RightarrowFont size

2.Rstudio创建新的工作目录

New project\RightarrowExisting Directory\RightarrowBrowse\Rightarrowcreat project\Rightarrowgetwd('')查看是否已转到该目录

3.Rstudio创建新的脚本

file\RightarrowNew file\RightarrowR.script\Rightarrowctrl+s\Rightarrow命名

4.Rstudio导入数据

(1)通过对话框导入

import Dataset\Rightarrowfrom Text(base)\Rightarrow选中文件\Rightarrowopen\Rightarrow改名\Rightarrowheading(Yes)\RightarrowEncoding(Automatic)有中文字符则选UTF-8\RightarrowRow name(use first column)\Rightarrowimport

(2)通过代码导入

gene_exp <- read.delim("path/to/the/file", row.name=1)

5.保存数据

(1)以制表符格式保存(适用于linux系统打开)

write.table(sample_cor, file = 'sample_cor.csv')

sample_cor是要保存数据的向量名,file = 'sample_cor.csv'是保存的文件名。保存的路径就是工作目录。

(2)以excel表格格式保存(适用于windows系统打开)

write.csv(sampl_cor file = 'sample_cor.csv')

6.结果可视化

(1)导入数据

使用前面的两种方法中的任意一种导入数据。

(2)计算样样本相关性

gene_cor <- cor(gene_exp)

(3)进行可视化

install.packages("pheatmap")\Rightarrow library(pheatmap)\Rightarrow pheatmap(gene_cor)

7.安装zip格式的软件包

有时在Rstudio里会出现命令安装软件包不成功的情况,若是可以找到该包的压缩文件(zip或tar.gz),可采取下面的方式安装
Rstudio \Rightarrow Tools \Rightarrow install.packages\Rightarrow install from package Archive File\Rightarrow package Archive
写在最后:

对R语言中任何函数有不明白之处可以用"?+函数名称"进行使用方法的查询

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