三十六策 第 14 策 三才合一

三十六策 第 14 策 三才合一

三十六策 第 14 策 三才合一

KEGG 把通路分为七大类，是全面覆盖的分法:

第一类是代谢;

第二类是遗传信息传递，包括基因转录、翻译、蛋白转运、降解等;

第三类是环境信息传递，包括膜转运和信号传导，这是疾病中最活跃的一类，跟医学研究息息相关，那些百搭通路基本都在这里面;

第四类是细胞生物学过程，包括细胞周期、凋亡、自噬、粘附等表型，一个表型就是一个通路;

第五类按照器官系统来分类的，有神经系统、循环系统、免疫系统等等;

第六类是疾病，

第七类是药物。

通路芯片+Western 就是基本上百分百能做出机制的万全策略。

二元变量的 4 种模式是多元变量关系的基本构成单元，而三元恰好回答了一个研究对象，往上找驱动因素，往下找效应环节的逻辑闭环，形成了一个完整的科学故事结构。它调控了谁，以及它被谁调控都照顾到了。

基础研究中的三元变量就是解答了一个科学现象也就是表型背后的三个关键科学问题: 主变量是谁?被上游哪个因变量调节?下游调节哪个因变量?

三元变量要先拆分成二元结构来整理，然后再证明三元间的必要性(Rescue 验证)。先两两配对把调控关系证明完，然后 Rescue 把变量串起来。假设课题创新性在分子上，药物+分子+通路中把分子作为主变 量，那么药物就是分子上游的驱动因素，对药物来说分子是新发现的作用靶点，而通路是分 子下游的效应环节，这是一套很规整的科学假设框架。

药物+分子+通路

三元变量论证，根据二元逻辑拆解开有

三组关系:1)药能调分子;2)分子能调通路;3) 药能调通路。

还有一组必要性论证，也就是 4)Rescue 环节:药调节通路依赖分子。然后跟表型相关的 Rescue 还有三条:1)药物调节表型依赖分子;2)分子调节表型依赖于通路，3)药物调节表型依赖于通路。

再加上两个二元关系的直接作用细节:1)药怎么调节分子;2)分子又怎么作用于通路的具体机制

假设药物和通路调节表型已知，那么上一策讲过的二元变量论证三条原封不动: 1)分子调节表型;2)分子调节通路;3)分子调节表型依赖于通路。还需要再加上 4)药物调节分子和通路;5)药物调节表型依赖于分子，一共 5 条关键证据链。