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当 相分离 遇上 新冠病毒......

当 相分离 遇上 新冠病毒......

作者: wxgzh_在学习中思考 | 来源:发表于2020-06-21 17:21 被阅读0次

    相分离(Phase Separation)现象是近来在生物学领域研究的十分火热的前沿研究热点,目前已经有大量生物学过程被报道与相分离相关。而与此同时,该物理现象是否真的在生物学过程中具有如此重要的价值与意义也备受质疑。

    新冠肺炎(COVID-19)是由新型冠状病毒SARS-CoV-2导致的传染病,目前正在全球引起大流行。近期与该病毒以及其导致的疾病的相关研究正在迅速增长,从该病毒的序列分析,到病毒蛋白特性及病毒进入人体的机制,最后引起的疾病及相关免疫应答和治疗策略。这一系列的研究都加速了人类对SARS-CoV-2及COVID-19的认识。

    然而,作为目前前沿的两个研究热点,当它们结合在一起,又会带给我们怎样的认识、思考及启示呢?

    一、新冠病毒的蛋白能形成相分离

    随着SARS-CoV-2的基因组及相应蛋白的解析,研究人员近期对SARS-CoV-2病毒相关蛋白展开了大量研究,其中就包括有病毒蛋白的相分离相关的研究。

    2020年06月10日,在预印本网站bioRxiv上线了题为“SARS-CoV-2 nucleocapsid protein undergoes liquid-liquid phase separation stimulated by RNA and partitions into phases of human ribonucleoproteins”的研究,该研究发现:

    来自SARS-CoV-2的多价RNA结合蛋白--核衣壳蛋白N--能够通过液液相分离(LLPS)的形式包装RNA,且该相分离过程可被RNA及pH调节;此外,该N蛋白能够进入人类核糖核蛋白TDP-43, FUS, 及hnRNPA2形成的相分离中。因此,该研究表明LLPS可能对于SARS-CoV-2及其他RNA病毒的基因组包装、与宿主蛋白的共存、病毒的复制和感染功能等都十分必要。

    类似地,2020年06月12日,在预印本网站bioRxiv又上线了一篇题为“Specific viral RNA drives the SARS CoV-2 nucleocapsid to phase separate”的研究,该研究同样发现:

    SARS-CoV-2的N蛋白能够与病毒基因组经历LLPS的过程。具体来说,N蛋白在生理条件下能够与病毒基因组5‘端前1000个核苷酸中的特定RNA序列发生相分离,且在人体上呼吸道温度的条件下可以得到增强。此外,作者进一步发现,N蛋白在哺乳动物细胞中的形成的相具有浓度依赖性,且可以被小分子影响。因此,该研究揭示了SARS-CoV-2的N蛋白所形成的相具有序列和结构特异性、对人体温度敏感、且用小分子可控,这为抗SARS-CoV-2病毒的有效小分子筛选提供了筛选基础。

    二、新冠病毒的靶向药物能参与相分离

    2020年06月19日,来自美国Whitehead Institute for Biomedical Research的

    Richard A. Young团队在Science上在线发表了题为“Partitioning of cancer therapeutics in nuclear condensates”的报道文章:

    该文章指出靶向肿瘤的一些合成化合物药物能够参与形成相分离过程,这一发现为肿瘤药物发挥效应作用提供了新的理解。而靶向新冠病毒的药物是否也类似能够通过参与相分离发挥作用,以及如何筛选能够靶向特异性相分离区域的药物仍有待探究。

    据2020年06月18日来自Nature News的报道介绍:

    目前已有研究组正在研究新冠病毒SARS-CoV-2的复制过程中的病毒蛋白的相分离,并且也有靶向抑制该复制过程且能够特异性地参与其相分离过程的小分子筛选研究。

    最后

    目前,相分离仍然是许多生物学过程中的研究热点,而新冠病毒SARS-CoV-2也正处于研究火热的时期,这使许多研究人员尝试将相分离现象与新冠病毒结合起来开始研究,包括病毒本身蛋白和RNA的相分离现象,以及靶向小分子药物靶向参与特定相分离过程。然而,因为近年来相分离现象被用于解释许多生物学过程,相关数据和结论仍有大量值得商榷,使得相分离近期一直备受讨论甚至质疑。所以,当该现象与新冠病毒研究结合时,其意义与价值将更值得研究人员进一步深入思考与讨论,而不能使热点仅仅只能存在于实验室数据及理论模型之中。

    参考资料:

    https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.09.141101v1

    https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.11.147199v1

    https://www.nature.com/articles/d41586-020-01838-z

    https://science.sciencemag.org/content/368/6497/1386

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