美文网首页生信学习good code 免疫浸润
2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析肿瘤

2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析肿瘤

作者: 卅衣 | 来源:发表于2020-02-20 21:24 被阅读0次

因为在网上看了一些视频,然后用数据试了一下,发现一直在运行,打开代码一看,发现是我看不懂的,也不知道哪错了,在网上搜了半天,不是要钱就是故意给你改错的,网页版的注册还不成功,换成英文搜了一遍,发现还是外国人好,现在分享给大家学习一下。

PubMed

PubMed上有一篇文章,专门介绍了CIBERSORT的使用说明


image.png
image.png

我们使用的时候,安装好需要的包,然后将文件和CIBERSORT.R放到同一个目录下,运行下面的语句


image.png

CIBERSORT.R

这个是在https://rdrr.io/github/singha53/amritr/src/R/supportFunc_cibersort.R
这个网站上的,直接复制另存为CIBERSORT.R,打不开的可以看下图

image.png
image.png
image.png
image.png
image.png
image.png

相关文章

网友评论

    本文标题:2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析肿瘤

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/zrufqhtx.html