今天分享一篇,最近发在《Plant Cell and Environment》的通过单细胞来揭示橡胶树应答白粉病早...[作者空间]
这篇关于单细胞的综述发表于2017年7月的Molecular Aspects of Medicine,Identi...[作者空间]
1. 注释开放区域 将已识别的无核小体区域与基因组特征(如基因和增强子)相关联通常很有趣。 一旦注释到基因或增强子...[作者空间]
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装,它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbo...[作者空间]
ATACseq ATACseq - 使用转座酶并提供一种同时从单个样本的转录因子结合位点和核小体位置提取信号的方法...[作者空间]
1. 结果处理 现在我们已经处理了 Greenleaf ATACseq 双端数据,我们可以开始处理比对。 首先,我...[作者空间]
这里是佳奥!我们继续clean数据的比对。 1 使用bowtie2进行比对 用bowtie2进行比对和统计比对率,...[作者空间]
写在前面 快一年了,写了重测序三兄弟插件,几乎所有用户都可以用 TBtools 轻松完成 BSAseq 数据分析。...[作者空间]
凌恩生物合作合作河海大学李轶课题组于《Science of the Total Environment》期刊发表“...[作者空间]
Bismark是进行甲基化分析过程中常用到的软件,可以将bisulfite处理后的测序reads比对到参考基因组上...[作者空间]
许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些...[作者空间]
基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因...[作者空间]
单细胞测序方法和原理系列: 1. 单细胞转录组建库原理:SMART、TargetAmp和10X genomics[...[作者空间]
单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生,我们今天就来...[作者空间]
Guideseq是一种检测体内基因编辑脱靶的测序方法,基本原理是CRISPR系统剪切基因组后,在进行基因组修复时可...[作者空间]
2020年03月,《Methods》杂志上发表一篇关于表观组学ChIP-seq分析方法的综述文章,详细介绍了染色质...[作者空间]
Tajima D 这个是选择相关的一个参数,大于0代表群体观测杂合度高于预期杂合度,稀有等位基因频率降低(群体收缩...[作者空间]
转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组,与特定DNA序列结合 (T...[作者空间]
近日,凌恩生物客户中国农业科学院棉花研究所邢朝柱研究员团队发表在《The Crop Journal》的研究论文“T...[作者空间]
欢迎关注Bioinfor 生信云! 上一篇推文讲了bulk RNA-Seq 的数据清洗部分,接下来就是将清洗后的数...[作者空间]