2020年7月,由欧洲分子生物学实验室欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)领导的国际合作研究团队在《Natur...[作者空间]
表观基因组关联分析(Epigenome-wide Association Study,EWAS),即基于全基因组范...[作者空间]
染色质免疫沉淀、DNase-I超敏反应和转座酶可及性分析结合高通量测序,使染色质动力学、转录因子结合和基因调控的全...[作者空间]
近年来,长非编码RNA(lncRNAs)在人类疾病中的作用越来越受重视。目前已有的lncRNA数据库信息大都集中在...[作者空间]
scRNA-Seq技术揭示了不同细胞组间基因表达水平的显著差异。然而,大多数的研究集中在mRNAs的分析上,lnc...[作者空间]
来自瑞典和美国的研究人员开发了PanglaoDB数据库,一个用于探索小鼠和人类scRNA-seq数据的网站,为单细...[作者空间]
在特定的细胞或组织中,发挥作用的转录因子在调控网络中的地位也是不同的。来自胚胎干细胞和其他细胞模型的研究表明,一小...[作者空间]
转录调控网络(TRN)的重建是人类遗传学中的长期挑战。已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子(TF)...[作者空间]
基因表达程序的错误调控已被发现会引起多种人类疾病。转录因子、染色质调控因子和非编码RNA均可调控基因表达。癌症转录...[作者空间]
miRNA是重要的转录后基因表达调控因子,并在各种生物学过程中发挥关键作用。据报道,miRNA的异常调控与多种疾病...[作者空间]
转录因子(TFs)可以通过结合其启动子或增强子的特定DNA序列来调节靶基因的表达。鉴定人中的TF-靶标调控是了解生...[作者空间]
AnimalTFDB是一个全面的数据库,有经过鉴定、分类和注释的97个物种全基因组水平的125,135个TF基因和...[作者空间]
转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子...[作者空间]
一个转录因子能同时控制多个基因的表达,同时转录因子的功能作用也可能受多个调控因子的影响。Cistrome DB就是...[作者空间]
DNA甲基化是当前研究最多的表观遗传修饰,对于促进胚胎发育,基因组印记和X染色体失活等重要生物过程至关重要。在甲基...[作者空间]
关于Python数据分析,其实网上能够找到的学习资源很多,主要分为两类:一类是提供各种资源的推荐,比如书单、教程、...[作者空间]
导语 m6A是mRNA和lncRNA上最普遍的RNA修饰,也是哺乳动物中最显著的RNA修饰。它在各种生物学过程和疾...[作者空间]
上一步差异表达分析拿到了表达谱【比如当用药物处理之后,实验组中哪些基因的表达发生了变化】 GO数据库 Gene ...[作者空间]
第一单元 lncRNA数据库 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于...[作者空间]
看文献的时候,发现了g:Profiler这个宝藏工具,测试了一下,使用起来超级方便、好用,一定要分享给大家~ g:...[作者空间]