Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与...[作者空间]
GSEA简介 基因集富集分析(GSEA)是一种计算方法,可确定先验定义的基因集是否在统计上显示两种生物学状态之间存...[作者空间]
分析流程 1.上传四个样本原始就文件到服务器 参考https://www.jianshu.com/p/a84cd4...[作者空间]
前面简单介绍过基因矩阵转置文件格式(* .gmt)[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...[作者空间]
常用富集分析包括GO富集、KEGG富集,这两种富集方式都是基于已经通过算法确定差异倍数的差异基因来分析的,而对于一...[作者空间]
单细胞数据挖掘||Garnett :基于监督学习的细胞注释算法 10X 单细胞细胞类型手动定义||Identify...[作者空间]
首先感谢Y叔的clusterprofiler神包,做富集分析优点是在线爬取数据,结果很可信,但是缺点也是网络问题,...[作者空间]
富集分析 基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一组基因或蛋白中找到一类过表...[作者空间]
GSEA is designed to analyze ranked lists of all available...[作者空间]
如前所说,过表达富集分析有不少缺点。因此以GSEA为代表的FCS方法也是人们所倾向的选择。接下来将简单了解下方法原...[作者空间]
基因集富集分析(Gene set enrichment analysis, GSEA)方法于2005年首次提出,题...[作者空间]
春节后的第一次写学习笔记,还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集!重要的事情说三遍! 前几天看到公众号里写了GS...[作者空间]
过表征分析(ORA, Over-Representation Analysis)是最初用于在大量差异基因寻找/...[作者空间]