继续Linux基础的教程，该教程内容是安装生信分析软件。 1.8 生信软件的安装 有root权限（可以使用yum或...[作者空间]
ORF与CDS ORF：open reading frame（开放阅读框） ORF定义1：一个ORF是指一段能够被...[作者空间]
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达...[作者空间]
之前都是用 fastqc+trimmomatic进行数据质控和过滤，但是fastp更方便也更快，而且可以一次完成质...[作者空间]
说在前面 Immugent在之前一篇推文中：CBNplot：可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp....[作者空间]
这里是佳奥，让我们继续转录组分析的学习！ 常用的软件：hisat2、subjunc、star、bwa、bowtie...[作者空间]
说在前面 相信大家在平时做富集分析时都会有这样的一个需求：如果能知道感兴趣的某条通路中各基因的调控关系，那么就能准...[作者空间]
一、hisat2进行转录组比对 1. 首先下载参考基因组 在NCBI,UCSC和Ensemble数据库都可以下载到...[作者空间]
以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章，现在整理为流程，同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析...[作者空间]
理论知识： 组织是由不同谱系和亚型的细胞类型组成的复杂环境，每种细胞都有自己独特的转录组。因此，批量转录组分析是细...[作者空间]
1. 介绍 CoRegNet包的目的是从转录组数据推断大型转录共调控网络，整合外部数据和基因调控信息去推断和分析转...[作者空间]
KEGG Bar plot 以bar的颜色和高度体现enrichment scores（比如pvalue），gen...[作者空间]
前言 MEGENA是一种基于图嵌入的方式构建基因共表达网络的工具，相比较于WGCNA的权重分析，MEGENA直接用...[作者空间]
三种获得基因长度的方法(qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s/iYuXXPMEsB...[作者空间]
网页在线版 https://igv.org/app/[https://igv.org/app/] 本地安装，下...[作者空间]
前面的文章中完成了数据导入和网络构建，下面是将基因模块与性状进行关联，从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA（1...[作者空间]
基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步，edgeR+limma是目前最为推荐的方式。本文结合示例数据，将对...[作者空间]
DNA文库构建 当我们使用二代测序技术对样本进行测序时，主要经过样本核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析和结果验...[作者空间]
一、rMATS简单介绍 rMATS是一款对RNA-Seq数据进行差异可变剪切分析的软件。其通过rMATS统计模型对...[作者空间]
