陈实富博士编写的 fastp 软件能实现 FASTQ 数据自动化过滤、剪裁、错误校正等功能，因其多样的功能和高效的...[作者空间]

1.准备本地数据库文件 NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗...[作者空间]

由于fastqc的结果 reads 长度分布有点奇怪，所以想看看是原始 Fastq 文件的问题还是 Fastqc ...[作者空间]

我们在测序的过程中，需要构建含有接头序列的文库分子，对于我们大部分实验人员来说，只是知道接头连接是如何操作，但是对...[作者空间]

BLOSUM62是应用得最广的氨基酸替换矩阵，是BLAST中蛋白质序列比对的默认矩阵。 1. 如何下载替换计分矩阵...[作者空间]

Comparing ELMER TCGA-BRCA and ATAC-seq inference linkages...[作者空间]

0. 简介 这篇文章是发表在Nature Methods上的使用深度学习来扩充可变剪切的分析。通讯作者是来自于UC...[作者空间]

前言 NormqPcR这个包用于对qPCR数据进行均一化(normalization，这里需要注意的是，这里的no...[作者空间]

我们在做多基因分析的时候，有时候会做需要对多个基因进行序列匹配来查看其序列之间的相似性，观察不同基因之间的序列的进...[作者空间]

转录因子(Transcription Factors, TFs)指能够以序列特异性方式结合DNA并且调节转录的蛋白...[作者空间]

本文来自文献《Single-Cell RNA Sequencing to Understand Host−Path...[作者空间]

数据转换 data transfer,是将数据从一种表示形式变为另一种表现形式的过程。我们喂给程序的数据在任何一个...[作者空间]

gganimate：让ggplot2图 随时而动。 常用参数 transition_*() defines how...[作者空间]

原文英文链接：ChIP-Seq Workflow Template作者：Daniela Cassol (danie...[作者空间]

工欲善其事，必先利其器。 ATAC-seq 已然成为表观遗传研究的利器，关于 ATAC-seq，我们可能需要知道以...[作者空间]

一：为什么要研究三维基因组？（三维基因组的必然性） 1.1 一维的染色体的情况  我们首先来看一个图 它展示了人...[作者空间]

写在写在前面的前面 或许，没有人知道TBtools到底是什么？能干啥。但是看完这个推文，或许你就知道了其中的一部分...[作者空间]

主要参考 祝让飞 的文章及 Tufts 网站中的信息，特此致谢。 首先放一张测序示意图，在DNA片段两端所加的序列...[作者空间]

Cutadapt安装 基本命令 例子： 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移...[作者空间]

关于链特异性测序的若干问题，很久以前就以为自己想清楚了，但是每次提起它的时候又容易重新产生各种各样的小困惑。于是整...[作者空间]