1.去除.narrowPeak文件首行 2.使用bedtools粗略估计两次重复的peak交集,重叠1bp就算有交...[作者空间]
跟着Cell学作图|7.富集分析(Metascape数据库) “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最...[作者空间]
常用id Ensemble id：由欧洲生物信息数据库提供，一般以ENSG开头，后边跟11位数字。如TP53基因：...[作者空间]
1. 环境配置 2. 数据下载 (1)prefetch下载 首先找到要下载的数据（SRR...号）创建projec...[作者空间]
新年快乐~ 1、chipseeker包的介绍： ①、南科大Y叔写的包，感谢②、主要是对peaks的注释和可视化 2...[作者空间]
使用 conda 安装 Homer 默认安装 homer 最新版conda install homer -y ...[作者空间]
1.拆分 >fastq-dump --gzip --split-3 SRR6449842 2.fastqc质量检测...[作者空间]
系列笔记基于达澈生物讲座视频，从中初步学习了解生信分析中常遇到的组学分析技术。ChIP-seq和 CUT&Tag、...[作者空间]
ChIP-seq试验普遍用于探究蛋白质与核酸的结合作用。例如最常见的，期望获得某个转录因子的功能，查看它结合到哪些...[作者空间]
（由于以前的几篇文章被平台锁了且申诉失败，只好重发一下） 在看paper的时候，经常会有这种图： 这是从UCSC ...[作者空间]
ChIP-seq数据分析实战训练（一） 一、安装软件（conda） 二、下载数据 参考文献 Brookes, E....[作者空间]
参考： 本讲 PPT 下载链接为：http://pan.baidu.com/s/1skJAaAx，密码：ga2l视...[作者空间]
刘小泽写于2020.5.23-24Y叔的原文在：https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0x...[作者空间]
全文分析流程学习按照：九月学徒ChIP-seq学习成果展 一、 怎么将SAR文件转为fastq文件？ 1. 【方...[作者空间]
说到三维基因组可视化，就不得不说一下washU（http://epigenomegateway.wustl.edu...[作者空间]
放在最前面的参考链接：给学徒的ATAC-seq数据实战（附上收费视频) 数据来源的文章： The landscap...[作者空间]
