最近整合了团队的几部机器,做成了小集群,于是很多计算环境重新部署。这两天有个项目需要返工,发现之前流程代码无法正常...[作者空间]
写在前面 前段时间,推过两个教程,分别是:1.《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM....[作者空间]
经常遇到‘一个循环绘制每一个差异基因在肿瘤和正常的表达差异’和‘需要在一张图中展示多个差异基因在肿瘤和正常组的表达...[作者空间]
有时候,我们从GEO数据库挖掘了好几组数据集的差异表达基因,我们需要统计这些基因列表的交集,一般可以用韦恩图和Up...[作者空间]
如果说别人画图是折腾自己,那我画图可能就是折腾自己兼折腾群主.......首先在这里感谢何大哥哈(知乎:hewm2...[作者空间]
前言 对跨物种的RNA-seq进行标准化和差异分析已知是一个问题,而目前对此类问题的相关研究还比较少,有用RPKM...[作者空间]
写在前面 目前基因组测序和组装成本几乎已经到任何一个课题组都可以单独负担的价码,大量物种的基因组序列被测定和释放。...[作者空间]
写在前面 五年前,《生信札记》公众号成立不久,我间断发了几个推文,然后就没再继续运营了。直到三四年前,花了点时间,...[作者空间]
国际惯例先上图 再放链接:Gitee repo - ShawnMagic / ShawnTBPluginR[htt...[作者空间]
今天公众号的一位读者留言问有了SSR的数据,如何画树状图? SSR的数据我也是第一次接触,我看了一下他发给我的数据...[作者空间]
首先我们进入STRING网站的官网(网址为https://string-db.org/[https://strin...[作者空间]
果子老师做过一个非常惊人的举动,用DESeq2处理1225例样本的TCGA数据,在没有使用DESeq多线程参数pa...[作者空间]
SnapGene是我在学分子克隆实验中最常用的软件,不能想象没有SnapGene的生活。SnapGene经过不断更...[作者空间]
序列比对是非常基础的工作,生物信息学分析大多涉及到这一步骤,虽然大部分人不做相关算法或软件的开发,但是了解总体的算...[作者空间]
vcf文件储存的是样本的变异信息文件,在同一批次分析中,如果不是采用joint calling的方式进行分析,最终...[作者空间]
一致度和相似度 两条长度不同的序列做全局比对,然后计算全局比对中一致字符的个数和相似字符的个数,再除以全局比对的长...[作者空间]
【点击查看小抄】 这里汇总的信息和视频解读推荐每个想要进阶和学习 R 包开发的读者看一看,是我两年开发经验的一个总...[作者空间]
本文转载于百迈克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群体遗传学...[作者空间]
于 2020-05-29 那天,期盼已久的 dplyr 1.0.0 终于出来了(emm,鸽了半个月)。 dplyr...[作者空间]
当我们在 R 控制台数据多行代码时,默认会用 + 符号将多行代码连接。 它的好处是我们获取了提示输入的信息,但坏处...[作者空间]