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美化cytoscape图片

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作者: 柳叶刀与小鼠标 | 来源:发表于2020-10-22 23:44 被阅读0次
  • 首先我们进入STRING网站的官网(网址为https://string-db.org/),选择好蛋白的输入方式后,输入一列差异基因,STRING网站对基因的限制条件是不超过2000个基因,格式也是每行一个基因名(蛋白名)。先选择“Multiple protenins”,然后输入基因名,最后选择“Homo sapiens”。
  • 然后点击“SEARCH”选项,继续点击“CONTINUE”选项。


  • 直接点击“Exports”选项,下载TSV格式的文件保存。


  • 导入数据:File-Import -Network-file,然后选择TSV格式的文件。


  • Layout>Circular layout


  • 我们依次点击Tools- NetworkAnalyzer-Network Analysis-Generate style from statistics。


  • 修改线图宽度为1


  • 最终成图


    image.png

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