寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关...[作者空间]
我们在采用monocle做细胞拟时序分析的时候，常常会不满意于原图的配色，而软件自带的配色是根据降维后分出的cel...[作者空间]
一、背景知识 文献：https://www.aging-us.com/article/103695/text[ht...[作者空间]
原文链接Chapter 10 Clustering[https://osca.bioconductor.org/c...[作者空间]
简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果（cluster、state）--------确定...[作者空间]
记录基础操作，预防“老年痴呆”。 单细胞数据分析难免要对细胞分群下手，那让我们康康都有哪些基础知识吧： 一、基本函...[作者空间]
示例数据：GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ge...[作者空间]
scRNA基础分析-1:安装包、导入数据、过滤质控 - 简书 scRNA基础分析-2：降维与聚类 - 简书 s...[作者空间]
scRNA基础分析-1:安装包、导入数据、过滤质控 - 简书 scRNA基础分析-2：降维与聚类 - 简书 s...[作者空间]
作者：ahworld链接：R函数实现单细胞StackedVlnPlot来源：微信公众号-seqyuan著作权归作者...[作者空间]
一、文章基本信息 （1）题目：单细胞测序揭示了骨关节炎发展的潜在发病机制（2020）（2）期刊名：Gene（3）2...[作者空间]
01—研究背景 记得在两年前刚学生信时，和很多小伙伴一样，在做完差异基因分析或者进行基因特异性筛选时，发现结果有几...[作者空间]
拟时序分析指的是根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况，构建细胞谱系发育。这个时间并不是真的时间，而是一个虚拟...[作者空间]
其实我看单细胞的各种资料，已经断断续续看了有一段时间了。只是没有整理出来，就从今天这篇上路吧~且搜且查，加上问豆豆...[作者空间]
在笔记1中，完成了GO和KEGG的enrich，后面的可视化其实非常简单。 1.气泡图~ dotplot(ego,...[作者空间]
1.写在前面的话： 近年来，由于细胞的异质性及发育分化等相关的问题越来越被研究者们所关注，单细胞转录组分析为研究异...[作者空间]
常用的分析方法： 过表征分析 (over representation analysis, ORA) ：先找出差异...[作者空间]
