在这个不平凡的2020的最后几天,林小姐的Group project分工分到了对155篇文章进行是否是RCT(Ra...[作者空间]
这次和大家分享下利用ggmaplot绘制差异基因筛选后的火山图,用到的基因集是ggpubr里面自带的数据集diff...[作者空间]
(IV)Bismark甲基化提取 Bismark附带一个补充的bismark_methylation_extrac...[作者空间]
官方手册(2020 Sep更新)https://github.com/FelixKrueger/Bismark/t...[作者空间]
ATAC-Seq信息分析流程主要分为以下几个部分:数据质控、序列比对、峰检测、motif分析、峰注释、富集分析,下...[作者空间]
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、...[作者空间]
#问题: #1. 检查R包的安装 是否调用的所有R包都已安装 使用root安装,在个人用户下安装是不行的。 或,下...[作者空间]
shinydashboard包提供了一组用于创建生成仪表板的HTML的函数。 #结构概要 dashboardPag...[作者空间]
Shiny 是RStudio公司开发的R包,利用Shiny 可以轻松构建交互式Web应用程序(App)。 在前面一...[作者空间]
#R包导入 #数据 数据下载pbmc_stim 数据导入 #初始化Seurat 对象 使用Harmony之前,需要...[作者空间]
Fast, sensitive and accurate integration of single-cell d...[作者空间]
在Seurat主导的单细胞世界里,Scanpy算是有点小众了。可是坑爹的是自己还必须用scanpy(谁让流程已经搭...[作者空间]
分位数归一化就是将多种分布映射到同一种分布。可以指定一个参考分布,将其映射到其它的统计分布;或者从需要处理的这些不...[作者空间]
Chord Diagram弦状图-用来画富集分析的结果 前面看的文献中,有一个很漂亮的圈图,https://mp....[作者空间]
最近刚返校,事情比较多,每天也很忙,之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建(上)》也一直没来得及更新,缺...[作者空间]
GEOquery 包使用指南 1 Overview of GEO1.1 Platforms1.2 Samples1...[作者空间]
#1 安装Aspera 下载地址:https://downloads.asperasoft.com/connect...[作者空间]
一、数据准备 首先,选取不同物种的Protein数据集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citru...[作者空间]
Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature P...[作者空间]
在做生信下游基因分析的时候,我们通常需要下载兴趣基因的序列信息构建进化书什么的,如果兴趣基因比较少,那么可以直接在...[作者空间]