#1 安装Aspera
下载地址:https://downloads.asperasoft.com/connect2/
NCBI首页也有提供下载:
到了下面这个页面,一步一步操作:
See the source image
#2 使用Aspera上传数据
##2.1 上传数据时,NCBI上建议的命令行:
ascp -i <path/to/key_file> -QT -l100m -k1 -d <path/to/folder/containing files> subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:xxx
##2.2 ascp.exe
在本地找到ascp.exe程序位置,我的位置:C:\Users\用户名\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin,找不到就搜索一下。
进入ascp.exe所在位置:
cd C:\Users\用户名\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin
查看参数
ascp -h
Usage: ascp.exe [OPTION] SRC... DEST SRC to DEST, or multiple SRC to DEST dir SRC, DEST format: [[user@]host:]PATH
-h,--help Display usage
-i PRIVATE-KEY-FILE 密钥 (id_rsa)
-l MAX-RATE 上传最大速度
-d 存放数据的文件夹
##2.3 修改命令:
ascp -i <path/to/key_file> -QT -l100m -k1 -d <path/to/folder/containing files> subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:xxx
<path/to/key_file>
: Aspera密钥(asperaweb_id_dsa.openssh)所在位置,asperaweb_id_dsa.openssh在Aspera\Aspera Connect\etc下,将这个文件复制到目录./Aspera
下;现在路径为:C:\Users\用户名\AppData\Local\Programs\Aspera\asperaweb_id_dsa.openssh
修改反斜杠:
C:/Users/用户名/AppData/Local/Programs/Aspera/asperaweb_id_dsa.openssh
<path/to/folder/containing files>
: 存放测序数据的文件夹
xxx
: NCBI已经提供
##2.4 注意:
- 文件路径斜杠改成反斜杠
- 文件路径不能有空格,即文件名不能有空格
- 文件路径不能有中文
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