GEO数据库-ID转换系列(一) 作者:jzhang 前言:我们都知道很多人在进行GEO数据库挖掘的时候,首先遇到...[作者空间]
笔记回顾:1.GEO数据库视频学习笔记(芯片数据下载和数据读取)2.GEO数据库视频学习笔记(ID转换)3.GEO...[作者空间]
解读GEO数据存放规律及下载,一文就够 原创 jimmy 生信技能树-----解读GEO数据存放规律及下载,一文就...[作者空间]
首先是学习优秀的帖子 最近处理数据发现同一个平台的RNA-seq或者芯片数据,不同的样本之间有时候竟然存在很大的差...[作者空间]
分析芯片数据应该都接触过 Bioconductor 上的注释包,像人种 org.Hs.eg.db 小鼠 org.M...[作者空间]
缺失值可视化 1.在GEO数据挖掘过程中,有时取子集会导致生成的子集都是NA。那么是因为代码写错了,或者数据类型没...[作者空间]
关于用getGEO下载数据后,会得到一个list,取出第一个列表中的元素后,再查看这第一个元素的数据类型后,发现他...[作者空间]
我下载了4个GEO乳腺癌的数据集,想要把它们整合为一个数据集,在获取了表达矩阵,提取了想要的数据,并且注释了探针名...[作者空间]
1.计算方法 肿瘤纯度的算法有很多种,这里使用的是Estimate。 R包的安装和自带测试数据见这篇http://...[作者空间]
GEO数据挖掘系列文-第一期-胶质母细胞瘤http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUz...[作者空间]