TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的...[作者空间]
TCGA Study Abbreviations Study AbbreviationStudy NameLAML...[作者空间]
花花写于2020-02-02,看似雄赳赳气昂昂,其实不难。我们是R语言的应用者,不是开发者,所以诸如差异分析,富集...[作者空间]
花花写于2020-01-15 本文是根据感兴趣的基因或条件构建模型,并用于预测,可视化的图就是风险森林图了。更新于...[作者空间]
今天跟大家分享的是去年十一月份发表在Frontiers in Genetics(IF:3.517)上的一篇文章,主...[作者空间]
博客地址:https://www.jianshu.com/u/619b87e54936 目录 R语言之可视化①误差...[作者空间]
今天跟大家分享的是十月份发表在frontiers in Oncology杂志上的一篇文章,该文章通过分析乳腺癌(B...[作者空间]
作者:白介素2 相关阅读:R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生...[作者空间]
一.加载表达数据,并分组 这里没有按照全部处理,直接加载了处理好的数据,前面处理数据的代码详解看见前面《TCGA数...[作者空间]
加载表达矩阵和生存数据 进行lasso回归,找到最佳建模位置 再用得到的最佳的位置去建模 判断预测结果的准确性 后...[作者空间]
作者:白介素2相关阅读:R语言配色方案02-RcolorBrewer包R语言配色方案01-colortoolsR语...[作者空间]
作者:白介素2相关阅读:[R语言生存分析03-Cox比例风险模型]R语言生存分析-02-ggforestR语言生存...[作者空间]
WGCNA(Weighted Correlation Network analysis)是一个基于基因表达数据,构...[作者空间]
选自ComplexHeatmap 完全指南 https://jokergoo.github.io/ComplexH...[作者空间]
如何解释相关系数 相关系数的值在 -1~1之间,1表示强正相关,0不相关,-1表示负相关 相关性矩阵可同时研究多个...[作者空间]
ggstatsplot介绍 ggstatsplot是ggplot2包的扩展,主要用于创建美观的图片同时自动输出统计...[作者空间]
grep()能对向量中特定条件的元素进行查询,默认return为index。grep()语法与grep()大致相似...[作者空间]
目录 R语言之可视化①误差棒 R语言之可视化②点图 R语言之可视化③点图续 R语言之可视化④点韦恩图upsetR ...[作者空间]
生信宝典之傻瓜式推出过基于Cytoscape的插件literature search进行文献挖掘查找指定基因调控网...[作者空间]
单基因生信分析流程(1)一文解决TCGA数据下载整理问题 单基因生信分析流程(2)一文解决差异分析和基因相关分析问...[作者空间]