1 sh 产生日志： sh **.sh &> xx.log 不产生日志： sh **.sh > /dev/null...[作者空间]
SNPs marker是全基因组范围应用广泛的分子标记，本文介绍生态基因组学中利用GATK4软件进行SNPs ca...[作者空间]
前期准备: 统计共多少条reads(pair-end reads这里算一条)参与了比对参考基因组 统计共有多少种比...[作者空间]
![[Linux]bedtools学习](https://img.haomeiwen.com/is20354525/462d77482ef93d57.png)
The BED format is a concise and flexible way to represent...[作者空间]
一.流程介绍 后续会开发lncRNA、smallRNA、circRNA流程首先是lncRNA流程，主要分析模块为：...[作者空间]
Kevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant...[作者空间]
CpG CHG CHH含义p代表磷酸二酯键，CpG指的是甲基化的C的下游是1个G碱基。H代表除了G碱基之外的其他...[作者空间]
Circexplorer2 参考文档： CIRCexplorer2手册 tophat的安装与使用 这个主要记录一下...[作者空间]
一般FastQC分析结果产生有2种类型的文件，一种.zip，一种.html。直接点击.html文件，即可在浏览器中...[作者空间]
注：后面可能还会构建鼠源的x参考： RNA-seq(5):序列比对：Hisat2 人类基因组hg19、hg38构建...[作者空间]
IGV需要的文件：比对文件为 bam和bam.bai文件 参考基因组文件...[作者空间]
[参考链接](https://www.jianshu.com/p/705a348e8623单细胞实战1,2,3,4...[作者空间]
一、新基因发掘 基于所选参考基因组序列，使用StringTie软件对Mapped Reads进行拼接，并与原有的基...[作者空间]
外显子测序： SE：单端测序 PE：双端测序，测得reads更长 测序深度：测序得到的待测区域总碱基数与待测区域大...[作者空间]
#美国弗吉尼亚 8核64G，高主频型 4.5rmb/h 新建用户 adduser wuxiaobin passwd...[作者空间]
序列的下载与指控 需要的序列 这一步主要是从各大数据库下载别人做好的高通量测序，可能一个样本会测好多次，就要下好多...[作者空间]
这次主要记录一下俺在使用该软件的时候遇到的问题。软件指路：ciriquant-cookbook 问题描述 这次使用...[作者空间]
生信软件及环境配置 安装Anaconda（没有程序需求可以装miniconda） 从官网下sh版本的直接安装在自己...[作者空间]
