前面已经简单介绍过GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程，我们在GWAS分析结果文件中经常会看到b...[作者空间]
IntAssoplot包可以将GWAS结果和LD， 基因结构图整合在一起画出。介绍来自：https://githu...[作者空间]
GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包...[作者空间]
===========第一种方法利用VCF2Dis生成距离矩阵=================== VCF2Di...[作者空间]
本文摘自：R 语言主成分分析(PCA)实战教程[https://mp.weixin.qq.com/s/uQPCPh...[作者空间]
当我们进行群体分析时，获得vcf文件后，可以根据变异位点对这些样本进行PCA分析，现简单介绍 1、软件安装 2、简...[作者空间]
最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画，haploview软件毛病比较多，比如不能有多态位...[作者空间]
往期教程 「群体遗传学实战」第一课: 对SNP位点进行注释 「群体遗传学实战」第二课: 画出和文章几乎一样的PCA...[作者空间]
主成分分析(PCA)是一种线性降维方法，能从纷繁复杂的数据中抽离出关键因素，用来区分不同的样本。这里我们不谈PCA...[作者空间]
分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础...[作者空间]
Manta star:193 update:2019-06-25 link 首页 文档 install 中文文档 ...[作者空间]
绘制染色体特定片段的LDheatmap使用LDheatmap包genetics转换数据格式[作者空间]
SAMBAMBA http://lomereiter.github.io/sambamba/ 一、安装 (支持ma...[作者空间]
LUMPY是一款基于概率框架检测结构变异(structure variants)的软件, 它根据read-pair...[作者空间]
