一、什么是单倍型？ 在单倍型分析前，首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型？ 一般来讲，所谓的单倍型是指同一染...[作者空间]
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有...[作者空间]
输入文件有：物种基因组序列文件、物种基因组注释文件、转录本比对后的BAM文件；以斑胸草雀为例：-基因组注释文件: ...[作者空间]
Nature Genetics | 抗条锈病小麦品种Kariega基因组组装与抗病基因Yr27挖掘[https:/...[作者空间]
要做选择性消除分析，首先就要把如下的理论记住熟记于心。 中性进化假说： 分子水平上，生物的演化或物种的进化并不是自...[作者空间]
看到一个可进行物种分歧时间估计的方法，是PAML中的一个子程序mcmctree。在此记录。 标题：PAML 4: ...[作者空间]
EMMAX是关联分析速度提升的一个代表性算法, 已广泛应用于棉花、大豆和水稻等的复杂性状关联分析。EMMAX认为，...[作者空间]
用Circos华丽地展现基因组信息，能给论文的锦上添花。很多做基因组分析的文章必有一个点就是展示基因组的圈图，目前...[作者空间]
Title: A genome-wide association study reveals that the g...[作者空间]
Genome-wide association study(GWAS)： 简单的说，使用统计模型找到与性状具有协同...[作者空间]
一、软件下载 http://software.broadinstitute.org/software/igv/do...[作者空间]
GAPIT (Genome Associated Prediction Integrated Tool),是一个R...[作者空间]
写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化，因此广泛应用于基因组学的研究中。下面我以windows下的IGV为例，...[作者空间]
我们进行GWAS分析，必须得有数据，那么什么样的数据，什么样的数据格式才能保证GWAS正常分析呢。今天主要给大家分...[作者空间]
上次给大家简单分享了GWAS分析一些简单术语及相关事件（https://www.jianshu.com/p/67e...[作者空间]
转载自：https://blog.csdn.net/yangl7/article/details/10920204...[作者空间]
ABBA-BABA分析方法最早发布于2012年NATURE的文章：Butterfly genome reveals...[作者空间]
基本概念 基因渗入(introgression)： 是在遗传学中，指两个基因库间的基因流动，通常是经过种间杂交产生...[作者空间]
目标 通过varscan等找到somatic mutations之后，想看多个样本的突变之间的交集。bcftool...[作者空间]
欢迎来到"bio生物信息"的世界 6天前，BMC Genomics 推了一篇文献“Population histo...[作者空间]
