本节概览：1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用cluste...[作者空间]
一、获得注释包中的GO信息 二、下载最新的KEGG数据库 三、将GOid转化为term 四、计算词条相似性 计算相...[作者空间]
期刊：《Frontiers in Genetic》 影响因子：4.599 文章题目：Metabolome and ...[作者空间]
获取本章节数据和代码：关注微信公众号：小杜的生信筆記（ID：Du_Bioinformatics），回复关键词：li...[作者空间]
最近在看植物长链非编码RNA的内容，数据分析里有个一内容是预测lncRNA的反式作用元件，通常的做法是利用表达量数...[作者空间]
转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程，一般从下机数据开始，经过一系列的质控，基因组比对，差异分析等过程得...[作者空间]
一. 简介 corrplot包是一个画相关系数图的包，可以用来对基因的表达数据进行分析，分析不同基因间表达的相关性...[作者空间]
相关系数计算：相关系数、P值 相关系数作图 补充ggcorrplot 更详细的作图细节可参考：https://ww...[作者空间]
目前GO注释主要分为两种方法，其一，序列相似性即blast，其二，结构域相似性比对（InterProsScan），...[作者空间]
01—研究背景 记得在两年前刚学生信时，和很多小伙伴一样，在做完差异基因分析或者进行基因特异性筛选时，发现结果有几...[作者空间]
一、质控 -- FastQC https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/...[作者空间]
自学生信两个月了，都是自己在网上东找找西找找，总觉得连门都没入。总说最高效的学习方法就是输出，而最好的输出就是教别...[作者空间]
首先推荐Kobashttp://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/genelist/上传你的...[作者空间]
导读：之前讲了如何用筛选出的差异基因做做相关性分析。那今天我和各位小伙伴深入的讲一下：（1）如何用clusterP...[作者空间]
接着前两篇文章：DESeq2详解系列(1)：https://www.jianshu.com/p/88511070e...[作者空间]
先了解完整的分析流程和工具：http://blog.sina.com.cn/s/blog_9cf2d3640102...[作者空间]
导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析，用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 ...[作者空间]
step1-Load Data and Quality Control 一、数据下载和读入 数据下载和读入，有与下...[作者空间]
生物信息分析中，接触最多的莫过于基因富集分析，故在此基础上目前已经开发了很多种富集分析工具，如网页版的DAVID、...[作者空间]
