今天分享一篇发表在NBT上的一篇叫做“Spatial metatranscriptomics resolves host-bacteria-fungi interactome...[作者空间]
今天分享一篇发表在MP上面的一个paper,是中国科学院分子植物科学卓越创新中心发表的,题目为"Single-ce...[作者空间]
光是植物生长发育最重要的调控因子,不仅为植物提供能源,还作为信号因子调控植物发育的整个生活史。其中,光、暗条件下幼...[作者空间]
土壤盐碱化问题日益严峻,已经成为全球范围内制约植物生长发育的主要环境因子之一。根系在植物应答逆境胁迫中具有重要的调...[作者空间]
植物病害对全球粮食安全构成了重大威胁,了解植物疾病发生机制,对制定有效的病原菌防御策略具有重大影响。但是,由于病原...[作者空间]
有时候看单细胞的降维聚类图,图例那里会显示亚群(或者cluster)的标签,有时候可能还有好几个,所以就在想怎么通...[作者空间]
随着身体年龄的增长,器官功能逐渐下降,患各种疾病的风险增加,包括心血管疾病、癌症和神经退行性疾病。了解身体如何衰老...[作者空间]
今天分享一个同样来自小鼠单细胞图谱课题组的另外一篇文章,在《Nature》上发表的,题目是“A single-ce...[作者空间]
今天分享一篇关于番茄愈伤组织的空转文章,是由北京大学现代农业研究院在PNAS上发表了题为“Spatial tran...[作者空间]
前面测试了常见的人类和小鼠的数据集,但是我自己是做植物的。如果想要运行pySCENIC,就需要去建立自己的数据库。...[作者空间]
继续跟着大咖们的步伐学习。(https://www.jianshu.com/p/c47332b880aa[http...[作者空间]
今天测试另外一个经典的人类pbmc的数据,是一个Seurat的对象。 #加载相关的包 library(SCENIC...[作者空间]
今天分享另外一篇关于小鼠的全组织单细胞图谱。它是由来自美国斯坦福大学的一个研究团队组建了一个名为Tabula Mu...[作者空间]
今天开始测试SCENIC的安装,先测试一下R版本的。 先安装一些必要的包。 ## Required BiocMan...[作者空间]
前面我们用自带例子和人类的pbmc数据测试了SCENIC的R版本的安装和使用。但是,通常情况下runGenie3这...[作者空间]
今天学习另外一个物种的单细胞全图谱,是关于果蝇的。 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的动...[作者空间]
lncRNA也算是近10年研究的热点之一了,我们以前实验室也做大量植物相关lncRNA的研究。lncRNA的功能也...[作者空间]
今天分享1篇拟南芥单细胞的文章,从种子到种子构建全生育期的单细胞图谱。 与大多数动物类似,植物经历了动态的胚胎后器...[作者空间]