适用背景 单细胞转录组调控网络分析是单细胞转录组分析内容的高级分析之一，本文将介绍SCENIC/pySCENIC的...[作者空间]
看到了jimmy老师的下述文章，才发现之前写的RNAseq实战还漏了个转录因子富集分析：常规转录差异建议都加上一个...[作者空间]
发表文章：SCENIC: single-cell regulatory network inference and...[作者空间]
AUCell 允许在单细胞 RNA-seq 数据中识别具有活性基因集（例如特征、基因模块……）的细胞。AUCell...[作者空间]
说在前面 生信宝库在之前的一篇推文：如何巧妙利用单细胞核糖体基因发NAR[https://mp.weixin.qq...[作者空间]
参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkN...[作者空间]
今天写一篇关于单细胞转录因子的分析-scenic在做分析之前你应该看一下这篇文献，看看别人做了什么scenic分析...[作者空间]
1.数据准备 用10x数据做scVelo，输入数据分2部分: Seurat 分析后的数据: 聚类、基因、细胞信息。...[作者空间]
AUCell：能够看出某个通路在细胞中的激活情况，在文章中可以用于差异比较，即这个通路多数在巨噬细胞中激活，而在其...[作者空间]
参考生信技能树：pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.co...[作者空间]
参考生信技能树：pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.co...[作者空间]
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轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
一、官方提供的安装方法 #详细的安装教程参考官网 https://github.com/aertslab/SCEN...[作者空间]
scVelo于2020年发表在Nature Biotechnology[https://www.nature.co...[作者空间]
AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集（如gene signature,gene module）的细胞...[作者空间]
一个很大的矩阵， 320127 行, 8189列，假如用一个全为0的普通矩阵来存储，需要用到9.8Gb 这里的0...[作者空间]
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R...[作者空间]
