2020-12-22写在前面的话:第一次做微生物实验,尝试各种分析,踩了不少坑,虽然现在picrust1大有被Ta...[作者空间]
inertial:可以是变量总方差(基于协方差矩阵的pca分析),也可以是变量自相关系数总和,等于变量数量。 ·S...[作者空间]
转换思想 接触到16s微生物测序数据的分析,微生物公司给的分析方法是先进行log1p转换,参考Borcard et...[作者空间]
如果环境因子会导致微生物种类发生较大变化,可以考虑选用Jaccard和Unweighted UniFrac,而如果...[作者空间]
1、de novo OTU 聚类,是将所有序列直接按照两两之间的相似度,划分成一个个OTU,选取该OTU中丰度最高...[作者空间]
在PCR反应中,在延伸阶段由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现。如下图所示:在扩增序列Template1的过程...[作者空间]
barcode和index是同一段核苷酸序列的称呼。 微生物测序量很少,一般4M reads就就可以了,但是对于高...[作者空间]
打开和保存 进入插入模式 快速定位命令 粘贴和复制命令 替换命令 直接在简单模式重替换,可以配合数字对多个字符同时...[作者空间]
1. 安装虚拟机及QIIME1 QIIME1官网[https://www.qiime.org] 2. 虚拟机增强功...[作者空间]