作为一名基础医学生，大家有没有这样的苦恼，那就是拿不到临床病人的样本，只能做小鼠！！！做就做呗，关键是好多基因集都...[作者空间]
在单细胞数据分析过程中，我们要分析某个亚群的特征，往往离不开找到与之相关的基因集/通路/转录因子/蛋白网络等，这时...[作者空间]
前言 在利用cellranger比对单细胞reads时，可以发现有STAR的进程夹杂在里面，那么STAR可以用来比...[作者空间]
前言 目前的课题是10X单细胞测序(植物方面)，之前已经把所有的流程基本走过一遍，现在就将自己的学习过程整理成笔记...[作者空间]
教程背景 这个例子演示了允许用户使用Seurat分析和探索多模式数据的新特性。虽然这只是一个初始版本，但我们很高兴...[作者空间]
单细胞RNA测序(scRNA-seq)和DNA测序(scDNA-seq)都可以应用于细胞水平基因组分析。对于突变分...[作者空间]
前面我们有介绍了利用10x Space Ranger软件分析空间转录组原始数据得到可用于下游分析的矩阵和镜像文件。...[作者空间]
Reducing barriers and accelerating single-cell research h...[作者空间]
Luecken M D, Theis F J. Current best practices in single‐...[作者空间]
[参考链接](https://www.jianshu.com/p/705a348e8623单细胞实战1,2,3,4...[作者空间]
在学习cellranger aggr这一步之前，还是需要再一次复习10x Genomics的测序原理。在cellr...[作者空间]
前言 今天想跟大家分享一下单细胞分析中的一个需求，就是如何将h5的表达量文件转化为常见的表达矩阵。大部分情况下...[作者空间]
刘小泽写于2020.7.19为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐...[作者空间]
单细胞数据挖掘||Garnett :基于监督学习的细胞注释算法 10X 单细胞细胞类型手动定义||Identify...[作者空间]
Integrating stimulated vs. control PBMC datasets to learn...[作者空间]
最近在学习芬兰CSC-IT科学中心主讲的生物信息课程(https://www.csc.fi/web/trainin...[作者空间]
简介 目前10X单细胞测序算是测序行业最热门的方向之一，它可以在低测序深度的情况下一次性的获得成千上万的细胞及...[作者空间]
目前单细胞测序获取细胞的方法主要有两种：（1）Smart-seq：测序细胞量少(因为一次通过一个细胞)，但是测序的...[作者空间]
