为什么要进行数据过滤 二代测序的下机数据经碱基识别得到的原始序列称为raw-data。raw-data中可能含有接...[作者空间]
TcellExTRECT应用场景 肿瘤组织的免疫微环境影响肿瘤进化,可以预测肿瘤对于免疫疗法的反应性以及治疗预后。...[作者空间]
PON构建方法一:vcftools PON构建方法二:GATK[作者空间]
用途: 计算组间相关性,并进行可视化 1.一组数据,单个矩阵 使用示例: 输入数据示例: 代码 1,输出相关性矩阵...[作者空间]
1,将UCSC的refFlat.txt转换成bed文件 基因全长bed refFlat.txt文件示例: hg19...[作者空间]
分析需求/适用场景 我们常常要比较N个元素的不同状态在两组间的分布情况,分析富集于一组的元素。那此时就可以对每个元...[作者空间]
FFPE测序数据检测变异面临的问题 通过对大量样本进行重测序技术(全基因组、全外显子组、目标区域)以剖析癌症的致病...[作者空间]
HER2 原癌基因或C-erbB2 编码一个单一的受体样跨膜蛋白,分子量185kDa,其结构上与表皮生长因子受体相...[作者空间]
原癌基因 ABI1ABL1ABL2ACSL3ACSL6AFF1AFF3AFF4AKAP9AKT1AKT2ALKAR...[作者空间]
文献名称: Meta-analysis identifies seven susceptibility loci ...[作者空间]
1.基于单位点关联分析power 1)在线工具一:gas_power_calculator** 网址:http:/...[作者空间]
如何去除文件中的换行符 Windows下保存的文本文件,上传到Linux/Unix下后总会在末尾多了一个换行符^M...[作者空间]
1背景介绍 Nanorpore即纳米孔测序技术,又称第四代测序技术,是Oxford Nanopore Techno...[作者空间]
乳腺癌的5种分子分型:1,Luminal A breast cancer :HR( hormone-recepto...[作者空间]
女性乳腺是由皮肤、纤维组织、乳腺腺体和脂肪组成的,乳腺癌是发生在乳腺腺上皮组织的恶性肿瘤。乳腺癌中99%发生在女性...[作者空间]
密度图也是比较常用的一种数据分布可视化的方法。今天小编分享一下用ggplot2绘制密度图的方法,代码很简单,但省去...[作者空间]
小提琴图由于其外形看起来酷似小提琴而得名,可以很直观的展示数据的分布,今天分享一下用ggplot2绘制小提琴的方法...[作者空间]
part1 Michael 团队在进行免疫细胞的实验时,发现有一类T细胞克隆(MC.7.G5),它在一种肺癌细胞系...[作者空间]
说到三维基因组可视化,就不得不说一下washU(http://epigenomegateway.wustl.edu...[作者空间]
简单介绍一下ggplot2 既然要做“系列”当然要先介绍一下主角-ggplot2。ggplot2是一个十分强大的R...[作者空间]