Dr. Qi Sun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任,长期以来从事生物信息学工作,在大数据的管理与分析上...[作者空间]
基于组装好的基因组,例如某一个基因在该基因组中无注释,需检查是否为注释错误,还是该基因本身缺失。 软件:genbl...[作者空间]
0.仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂具体每个参数的含义参照官方文档, 这里全部用默认参数https://...[作者空间]
https://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/C...[作者空间]
GFAP注释 go和kegg注释结果 实测比eggnogmaper的结果更全一点[作者空间]
verkko 和hifiasm比起来,慢很多,因为它有canu部分Verkko is a hybrid genom...[作者空间]
https://github.com/mdozmorov[https://github.com/mdozmorov...[作者空间]
写在前面 Emmm,基因组组装质量的评估标准有很多,伴随着测序技术的飞速发展,尤其是 pacbio hifi 和 ...[作者空间]
Verkko是一个用于实现端粒到端粒(telomere to telomere, T2T)基因组组装的新工具。 R...[作者空间]
写在前面 当我们关注某个基因时,在计划对其开始基因功能研究之前,往往需要先做「基因家族分析」,原因有几: 通过演化...[作者空间]
2023年3月10日,来自波多黎各大学Van Belleghem等多团队合作在国际顶级期刊《Science》上在线...[作者空间]
蝙蝠已经演化出独特的免疫系统来应对病毒感染,能够无症状地携带多种哺乳动物烈性病毒,包括尼帕病毒、亨德拉病毒、埃博拉...[作者空间]
一、 写在前面 2023年4月中旬自己开始做基因家族的分析,对于这块自己没有接触过,因此也是一个挑战,没事!!!(...[作者空间]
完成标记开发后,会得到基因型数据,首先要对基因型数据进行统计,用到的工具是plink,安装及基础用法见链接:pli...[作者空间]
主要探讨了脊椎动物大脑中神经元类型的分子多样性和进化。本文使用单细胞转录组学技术,对澳大利亚蜥蜴Pogona vi...[作者空间]
●英文题目:《Ancient Hybridization with an Unknown Population F...[作者空间]
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装,它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbo...[作者空间]
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程,适用于初学者入门阅读,从原始测序数据开始,经过质控、序列比对、定量表达...[作者空间]
背景许多短读reads组装的基因组被发现是不完整的并且包含错误。脊椎动物基因组计划一直在生产新的参考基因组组装,重...[作者空间]
本篇文章学习、解析的内容来自《Genomes of the Banyan Tree and Pollinator ...[作者空间]