前段时间,发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门,但在准备数据分析的过程中,仍感各种资料教...[作者空间]
叶绿体基因组在组装注释时是有可能出现错误的,本文主要针对NCBI反馈意见进行修改,NCBI一般会指出哪一段基因注释...[作者空间]
DnaSP 6.0计算 系统发育分支的多态位点数( polymorphic sites,S) 单倍型数( the ...[作者空间]
叶绿体基因组Pi分析(Nucleotide diversity) 今天主要分享绘制这一张图需要做的工作。 1. 准...[作者空间]
getorganelle[https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle]组装叶...[作者空间]
组装并注释完叶绿体基因组后,就要进行圈图的绘制。这里使用在线网站OGDRAW来绘制圈图。 主要参考教程:叶绿体基因...[作者空间]
【大致阐述一下操作思路,还没实际应用过】 所需软件:bandage所需文件:①fastg文件;②csv文件(这两个...[作者空间]
使用软件:Geneious目的:对组装好的叶绿体基因组进行注释,注释好后进行查看,无误后绘制圈图 【注释部分】 1...[作者空间]
我这里使用python和biopython,关于python和Biopython的安装可以参考我的B站视频 htt...[作者空间]
背景 orthfinder和直系同源基因介绍 生信基因功能分析工具:Orthofinder使用教程[https:/...[作者空间]
背景 二代测序技术(NGS)的快速发展促使各种有机体的高通量测序数据的累积,特别是细胞器基因组。因此,为了应对各...[作者空间]