最近发现差异基因用GO富集之后的terms自己并不感兴趣,所以找别的富集的办法,大家都知道kegg富集到的大部分都...[作者空间]
1 什么是GSEA 基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)是是一种...[作者空间]
之前我们发过GSVA分析(有了这个包,猪的GSEA和GSVA分析也不在话下(第一集)[http://mp.weix...[作者空间]
最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并,拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集,拿差异基因...[作者空间]
如果你觉得GO或KEGG不够解释,或许可以试试GSEA 具体内容参考这篇[https://blog.csdn.ne...[作者空间]
GSVA基因集变异分析结合limma包分析差异基因集 基因集变异分析即GSVA(Gene set variatio...[作者空间]
1. 数据和基因集准备 数据准备 基因集准备 使用AverageExpression函数提取分组平均表达矩阵 2....[作者空间]
1. 背景 Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)用来评估一个预先定义的基因集的基...[作者空间]
单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异,因此,功能分析在单细胞分析...[作者空间]
差异表达分析内容:• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts,RPKM,FPKM,TPM➢ PCA图、热图...[作者空间]
上一篇GSEA可以做什么之后,继续进行结果解读 1 Enrichment score(ES) ES是GSEA最初的...[作者空间]