linux basics Linux系统下一切皆是文件,Linux文件系统包含排列在磁盘或其他区块存储设备目录中的...[作者空间]
一、序 目前对蛋白基因家族进行分析主要有两种方法,一基于同源性,二基于HMM模型。想要通过HMM模型预测蛋白基因家...[作者空间]
pafr包的参考链接 https://cran.r-project.org/web/packages/pafr/v...[作者空间]
(1)是什么?含义是什么? ,全称为fixation index,是一种用于衡量群体间分化程度的统计检验量(由Wr...[作者空间]
本文介绍一款可用于宏基因组中的分类小软件,简单一条命令可以将上游组装的Contigs进行原核与真核生物区分~ Gi...[作者空间]
工具官网:https://rubd.github.io/Giotto_site/[https://rubd.git...[作者空间]
Normalization: 使数值在0-1之间 Standardization (又称为Z-score norm...[作者空间]
曹洋课题组 | Labshare 生物信息学在线软件集锦地址:http://www.labshare.cn/bio...[作者空间]
从NCBI下载了一些转录组数据,这里用到的下载工具是kingfisher ,github的链接是 https://...[作者空间]
我使用的maker版本为3.01.04 第一轮:将已知基因比对到基因组 包括两个部分:?屏蔽重复序列?将已知的转录...[作者空间]
转自:https://www.jianshu.com/p/d27d5ab8d6f0[https://www.jia...[作者空间]
在GEO数据库中我们经常会遇到下载的GPL平台文件没有基因名,或者我们所需要的基因在里面找不到 ①可能是由于数据集...[作者空间]
SAM格式规范(V 1.6) SAM为Sequence Alignment/Map格式,一种由制表符(Tab)分隔...[作者空间]
这可能是一篇以英国为中心的独特博文,但我怀疑不是。让我从一个简短的故事开始。几周前,我坐在食堂里喝咖啡,无意中听到...[作者空间]
Introduction 此课程是Coursera上,John Hopkins University 的 Geno...[作者空间]
1 文件准备 首先准备两个文件,一个是基因的cds序列,一个是蛋白质序列。 cds序列和蛋白质可以在ensembl...[作者空间]
遇到了一个16S的课题,于是开始认真学习ASV和OTU的差别,顺手整理一下。 扩增子测序和鸟枪法测序已经成为微生物...[作者空间]
1. FastqCount简介 快速实用小工具:FastqCounthttps://github.com/zhim...[作者空间]
懒人617回归,其实并没有偷懒。最近一直忙碌于手中的课题,没有时间来写文(当然这都不是借口)。作为一个有包袱的生信...[作者空间]
测序技术的飞速发展积累了大量转录组数据,从中也发现了很多新的转录本。区分这些转录本是蛋白编码序列还是非编码序列是基...[作者空间]