给孤独生物信息学者的指北

作者: 亦是旅人呐 | 来源:发表于2021-09-18 08:23 被阅读0次

这可能是一篇以英国为中心的独特博文,但我怀疑不是。让我从一个简短的故事开始。几周前,我坐在食堂里喝咖啡,无意中听到几个PI之间关于助学金申请的对话。“别担心”,首席PI说,“我们已经在申请上投入资金,资助一名生物信息学者”。很好的计划,我听你说,我同意;然而,请注意,讨论中没有一位PI本身就是生物信息学者;他们都不会编码;把他们放在Linux终端前,他们不知道该怎么办。

是的——我们见证了另一位“pet bioinformatician”的诞生。我所说的这个术语是指在实验室团队中雇佣的单个生物信息学者。这些家伙在英国学术团体中越来越常见,这让我很担心,因为他们可能会变得孤立,并接受不良做法,因为他们没有高级生物信息学者来指导他们。我还担心他们的职业和专业发展可能会受到影响。考虑一下相反的情况——PIS管理实验室人员有多少人?我们怎么可能指导一个年轻的博士后如何运行凝胶、PCR等,而不需要更复杂的实验室标准工作流程?我们不能——那么为什么基于湿实验的PI认为他们可以指导生物信息学者呢?

当你不具备员工在所选领域生存所需的技能时,必须考虑如何培养年轻或缺乏经验的员工。当你不了解自己时,你如何帮助他们?

本指北针对宠物生物信息学者,旨在指导他们更好地职业发展。


1.与当地的生物信息学团体交朋友

你可能不在当地的生物信息学小组,但如果有,就去找他们,介绍你自己,交朋友。询问你是否可以参加他们的实验室会议和期刊俱乐部。告诉小组组长,你希望确保学习生物信息学的良好实践,并希望得到他们的帮助。如果你所在的研究所没有,那么地理上最近的研究所在哪里?你能去见他们吗?如果是,就去做;如果没有,尝试使用skype进行会议等。与互联网上的人和团体建立电子关系。建立一个支持小组,该小组将能够帮助您解决实验室小组无法解决的问题。


2.和你的计算机小组谈谈

找到他们,告诉他们你的工作是关于什么的,你需要什么资源,并询问他们如何在你所处的环境中最好地访问这些资源。如果您不知道需要哪些资源,请参见上文第(1)点。您当地的IT团队对您的成功至关重要。与linux系统管理员交朋友,他们可能会救你的命。


3.获得明确的期望

与你的老板交谈,让他们准确地概述他们对你的期望。如果你是靠补助金获得资金的,那就去申请补助金,并仔细阅读你的经理承诺你将提供的内容。让你的老板做好准备,让他们知道他们的期望可能需要改变,特别是如果他们不现实的话。


4.重写你的工作描述

用(3)和(1)和(2)改写你的工作描述,让你的经理充分意识到你能做什么,不能做什么。让他们知道事情需要多长时间,因为他们可能不知道。尽早这样做。如果他们不同意你对你能提供什么的估计,请向(1)寻求支持。给出现实的估计。请您的经理确定目标的优先级。


5.论文

你需要第一作者的论文,就像其他科学家一样。中间作者的论文只会让你走到这一步。提前告诉你的老板你的下一篇第一作者论文来自哪里。解释一下,对于某些项目,你会比实验室的人做更多的工作,所以应该获得第一作者资格(只有在这是真的情况下才这样做)。如果不存在任何可能性,请允许你发展自己的想法并发表。与(1)中的人交谈。


6.参加生物信息学会议

您的经理希望您参加与团队研究相关的会议。去这些地方,但也要求参加生物信息学会议和研讨会。


7.先试试,以后再问

这是一个微妙的平衡行为。没有什么比掌握一些数据或代码并尝试一下更好的方法了。尝试坐下来读一读,尽可能努力解决你遇到的任何问题。但请注意,您提出的解决方案可能是次优的。一段时间后,寻求帮助。向更有经验的人展示你所做的,并征求反馈。充分利用你所学到的知识和得到的反馈,把剩下的留给别人。没有人喜欢过早寻求帮助并希望别人告诉他们该做什么的人;我们都喜欢实践者。但不要走得太远;首先尝试你自己的方式,但在某个时候休息一下,寻求反馈和帮助。


我见过不止一个项目的结果几乎是100%的垃圾,因为一个生物信息学者是孤立的,没有寻求帮助。不要做那种人。别让你自己这么做。与其他生物信息学者在一起应该可以降低这种风险,因为他们能够在一切为时已晚之前发现你的错误。

确保你和团队中的其他成员一样受到高度重视,你的职业生涯得到了培养,你的技能得到了与团队中其他成员一样的发展。确保你的工作符合明确和现实的期望,并积极参与(重新)定义你的角色和工作描述。

如果你在学术界,就出版吧。请发表。中间作者是可以的,但如果你不想被视为一个促进者,第一作者是必不可少的。目标是一年写两篇论文。如果你的老板不能为你提供(课题),你自己去做,发表review,发布软件工具的比较。抓住你遇到最多的问题,解决它并发布解决方案。一开始,这似乎让人望而生畏,但要寻求帮助,你能做到。

照顾好你们自己,宠物生物信息学者。


多看文章多思考,有想法就动手去做,遇到困难寻求帮助,good luck and good health!

end


reference: http://www.opiniomics.org/a-guide-for-the-lonely-bioinformatician/

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