2023年2月，复旦大学邹欣/郝洁团队在Briefings in Bioinformatics (IF=14) 以...[作者空间]
前言 在以往常规转录组测序中，由于实验生物学重复，同组内测序得到的数据是接近的，通过简单的线性降维PCA主成分分析...[作者空间]
常见问题： 1）Seurat CCA整合分析后什么情况下用RNAassay，什么时候用intergratedass...[作者空间]
Seurat对象中的Assay: ########################################...[作者空间]
学习目标： -构建质量控制指标，可视化地评估数据的质量-应用适当的过滤器去除低质量的细胞 单细胞RNA-seq:质...[作者空间]
首先做个总结汇总一下 1.检查自己下载的sra是否是完整的，validate.shu运行这个脚本，还在跑着2.制作...[作者空间]
1.单细胞转录组主要应用于： 深入了解组织中的细胞异质性 。 鉴定未知的细胞类型 。 鉴定已知细胞类型的亚型 ，原...[作者空间]
单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e8...[作者空间]
全网最全 GO 注释结果绘图，直击 SCI 绘图标注，关注我，您最好的选择！ 前言 1. GO 原理 基因组测序已...[作者空间]
写在前面 之前介绍过使用EggNOG-mapper对非模式物种快速完成KEGG注释的推文https://mp.we...[作者空间]
生信分析过程中的文件格式：除了原始测序数据fastq、fasta之外，还有基因组文件fasta格式，基因注释文件g...[作者空间]
1. 分析流程 Basic algorithmsExpression quantification and qu...[作者空间]
hello，大家好，今天我们来初步总结一下所有单细胞分析用到的NMF。 我们先来简单回顾一下批次矫正的方法lige...[作者空间]
Sequence Read Archive (SRA) 2021.8.13 HuPY 1. OverView Pr...[作者空间]
我们在得到单细胞数据raw count以后，需要对单细胞进行一个标准化处理，然后再进行下游分析。 在scRNA-s...[作者空间]
![教程 | [下篇] 规模化物种同源基因分析 - orthofin](https://img.haomeiwen.com/is10518391/8d2afcb35470fddb.png)
写在前面 两个月前，我推送了一个师妹的投稿，介绍了orthofinder软件的应用场景和具体安装，属于上篇。有上便...[作者空间]
写在前面 基因组测序项目已然是几乎所有课题组都可以负担的水平。相比于几年前火爆的通过转录组测序挖掘生物学问题策略，...[作者空间]
