Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在两个及以上个体存在来源于同一祖先的、未发生...[作者空间]
illumina 双端测序(pair end) illumina测序的核心在于利用可逆终止的、荧光标记的dNTP进...[作者空间]
一、技术原理 基因组研究的维度可以分为很多种,例如下图所示 其中Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于...[作者空间]
比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是很漂亮的。 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。上一篇介绍了怎么利...[作者空间]
[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的...[作者空间]
基因组中重复序列大体分为两类:串联重复(Tandem repeats,Tandem Duplication) (T...[作者空间]
一. 简介 叶绿体是绿色植物,藻类和蓝细菌进行光合作用的场所,光合作用将水和二氧化碳转变为有机化合物并放出氧气。叶...[作者空间]
1、链特异性测序的目的现在二代测序主要有PE和SE两种策略,PE主要用于RNA-seq,SE主要用于小RNA测序(...[作者空间]
1. 什么是位点频谱(site frequency spectrum)? 位点频谱也叫等位基因频谱(allele ...[作者空间]
测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍; 指测序得到的总碱基数(bp)与所测物种基因组大小的...[作者空间]
嗨嗨,好久不见,太久没有更新啦。前几天和老师讨论实验的时候,他提到了这个数据库挺方便,之前只是听说过,没有研究过怎...[作者空间]
关于为何要进行SNP的过滤: 第一,低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果,甚至影响后续对生...[作者空间]
1.stack寻找位点1)数据预处理数据下机经过拆分去接头获得原始数据 由于拆分数据用的引物街头长度不一,获得的原...[作者空间]
RAD-Seq(restriction site-associated DNA sequencing)最开始指的是...[作者空间]
最近在对于一些关于基因组的数据进行处理,发现如果在NCBI上下载一个物种例如E. coil的基因组序列之后,有很多...[作者空间]