本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq数据分析流程 一、测序数据的介绍 测序数据主要有两个来源 1、自测的...[作者空间]
欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2],每一步处理数据的目的都是不同...[作者空间]
最近在写进行转录组数据的分析文档,前面介绍了如何根据差异基因绘制火山图,今天来介绍如何通过clusterProfi...[作者空间]
Kozak consensus sequence (Kozak consensus or Kozak sequen...[作者空间]
干扰RNA进行基因沉默的原理和方法: 越来越多的实验室利用 siRNA 敲低技术来评估细胞内蛋白质的功能。这项技术...[作者空间]
导语: 前面的推文简要介绍了Jalview的大体功能,本以为对该软件的需求不会很大。但是随着这几篇推文“,”中发现...[作者空间]
最近使用STAR比对出现了状况,软件版本和对应的Index不相容,报错信息如下 原因是之前构建好的index是使用...[作者空间]
做实验嘛,时间和精力的合理分配很重要,利用有限的时间高效完成各项实验的准备工作就显得尤其必要。毕竟需要把更多的时间...[作者空间]
Shell变量定义变量使用变量修改变量的值单引号和双引号的区别将命令的结果复制给变量只读变量删除变量变量类型 Sh...[作者空间]
三四十页的转录组的测序报告不知该如何入手,众多分析结果不知该关注哪些?今天我们就从RPKM到KEGG,慢慢给你讲解...[作者空间]
https://www.jingege.wang/2020/05/29/mfuzz%E5%8C%85%E8%BF%...[作者空间]
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featur...[作者空间]
参考这些???我觉得学RNA-seq必看的文献!!???这篇写的特别好:RNAseq-workflowRNA-se...[作者空间]
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的...[作者空间]