Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/](Kyoto Ency...[作者空间]
移步github获得更好的阅读体验 测序原理 共有的特点: 优点:无需前期扩增,不引入偏向性;读长长缺点:错误率高...[作者空间]
前言 GDCRNATools 是一个用于下载、整理和综合分析GDC中IncRNA、mRNA和miRNA数据的R/B...[作者空间]
前言 生物信息分析人员一般会接触到从NCBI等网站下载的SRA数据,之前也介绍了下载SRA数据的几种方式。下面,我...[作者空间]
前言 从事生物信息分析的老师和同学一般都会接触SRA数据,网上介绍的下载SRA数据方法也是各种各样,到底哪一种更好...[作者空间]
今天推荐给大家一个R包WGCNA,针对我们的表达谱数据进行分析。 简单介绍:WGCNA首先假定基因网络服从无尺度分...[作者空间]
刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文,练练手,为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Backg...[作者空间]
1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1)按分型百分比条件过滤,多数文章剔除缺失率在20%以上的位点,...[作者空间]
看这个之前,可以先看WGCNA的一些理论背景知识看完整个之后可以去看WGCNA关键模块和hub基因筛选 相似的表达...[作者空间]
系统功能注释和生物网络可视化 Spatial Analysis of Functional Enrichment(...[作者空间]
偶然间发现这个功能强大的软件,说起基因注释分析工具,会立刻想到DAVID。不可否认,DAVID的确能实现基因功能和...[作者空间]
写在前面,这篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional...[作者空间]
你会用到的网站: IGV 官网http://software.broadinstitute.org/softwar...[作者空间]
Pysam操作BAM文件 Pysam包是一个处理基因组数据的python模块,它打包了htslib-1.3、sam...[作者空间]
差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异,最简单的标准化方式是计算counts per millio...[作者空间]
RNA-seq看表达量高低是看哪个值?1.Read count(1)数值概念:比对到gene A的reads数。(...[作者空间]
什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分...[作者空间]
转录组学习一(软件安装) 转录组学习二(数据下载) 转录组学习三(数据质控) 转录组学习四(参考基因组及gt...[作者空间]
任务 载入表达矩阵,然后设置好分组信息 用DEseq2进行差异分析,也可以走走edgeR或者limma的voom流...[作者空间]
一、软件介绍该分析流程主要根据2016年发表在Nature Protocols上的一篇名为Transcript-l...[作者空间]