说在前面 说到细胞分化轨迹的推断，想必很多小伙伴第一会想到的是monocle2这个软件，但是它只能做到onesho...[作者空间]
大脑内有成千上万条的神经环路，是大脑处理复杂感知信息并产生相应行为的基础。剖析哺乳动物脑中细胞特异性的神经环路是神...[作者空间]
单细胞测序是在一样样本中可以检测成千上万个细胞的转录组情况，所以很多情况下我们可以根据配体受体等基因的表达情况来看...[作者空间]
单细胞测序可以检测一块组织中每个细胞的转录组情况，但其实一块组织中存在着不同发育状态的细胞，因此通过基因的表达情况...[作者空间]
参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkN...[作者空间]
0. 原理简介 10x公司的Visium空间转录组方法与10x的单细胞测序在原理上很相似。单细胞测序是用胶珠和油包...[作者空间]
说在前面 对于单细胞数据分析流程来说，其中最重要的一步就是对各种细胞亚群进行准确的注释，因为后续的分析全部在这个基...[作者空间]
看了很多教程，下面这两个个复现出来了。 1、Seurat包合并多个单细胞样本[https://www.jiansh...[作者空间]
之前我们发过GSVA分析（有了这个包，猪的GSEA和GSVA分析也不在话下（第一集）[http://mp.weix...[作者空间]
参考生信技能树：pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.co...[作者空间]
轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
Temporal single-cell tracing reveals clonal revival and e...[作者空间]
接前面的流程，我们使用FindIntegrationAnchors()[https://satijalab.org...[作者空间]
hello，大家好，礼拜天了，明天又要上班了，但是很想写一点东西，留下点足迹，但是又不想太动脑子，所以分享一篇代码...[作者空间]
上期，跟大家分享了研究思路 | 单细胞多组学如何研究？不要看别的了，一文让你懂的透透的（上） - 简书 (jian...[作者空间]
![文献学习019--[sc]人类胎儿心脏细胞图谱及其在自身免疫性心](https://img.haomeiwen.com/is15771939/b1ccfa7a1abc94f4.png)
作者对三个孕19-22周健康胎儿心脏和一个孕21周CHB(congenital heart block)心脏进行了...[作者空间]
细胞图谱构建、细胞亚群分析、稀有细胞类型鉴定、肿瘤微环境、疾病发生机制、耐药性、发育分化、免疫研究……，回顾近年来...[作者空间]
参考文献：Confronting false discoveries in single-cell differe...[作者空间]
