之前在twitter上看见一个老哥开发了一个网站 sra-explorer，大致意思就是能够解析你输入的SRA号，...[作者空间]
要说寻找公共芯片测序数据大家都知道上 GEO 查找，其实 EBI 也有个叫 ArrayExpress 的网站(网址...[作者空间]
最近偶然看到一篇生信建模的文章，思路清奇，让人茅塞顿开。 从标题上来看 是一篇分析胰腺癌甲基化异常的 基因的预后s...[作者空间]
十年前收集病人五年前公布数据今天发nature 文章信息 题目：Immune evasion before tum...[作者空间]
做实验的时候，如果想说清楚靶分子的重要性，常规操作就是在表达量低的细胞系中过表达基因，在表达量高的细胞系中敲减靶分...[作者空间]
昨天差一个帖子，明天补上。在之前我写过一个帖子R语言学习路上的忆苦思甜里面讲的是各种分组计算的方法，最终在我的知识...[作者空间]
芯片分析里面有一个比较困难的地方就是探针的注释，其实我们之前的帖子已经把各种不同的情况解决的差不多该了。除了使用R...[作者空间]
写在前面 伴随高通量测序技术的普及，海量的测序数据被产生并上传到网络数据库，如NCBI SRA。我们每个人都可以很...[作者空间]
肿瘤的临床指标异质性 关于肿瘤内部异质性的讨论，我们介绍了很多： MATH值代表的肿瘤异质性在乳腺癌与生存关系不显...[作者空间]
作者：白介素2 好久没有写稿子了，今天分享一篇纯生信文章,发表在scientific reports上，虽说很多人...[作者空间]
来源：http://www.bio-info-trainee.com/3750.html答案：https://gi...[作者空间]
复现这篇文献里的一幅热图 Tinagl1 Suppresses Triple-Negative Breast Ca...[作者空间]
上传数据时发现一个有趣的问题，自己不知道数据来自于哪个illumina的哪个测序平台，所以整理下如何根据FASTQ...[作者空间]
（重磅！价值一千元的R代码送给你）芯片探针序列的基因组注释 这是我第二次在标题上写重磅！价值一千元的代码，虽然下面...[作者空间]
在geo数据库的表格中，一个探针对应多个基因的情况，是这样表示的 我需要的是一行只对应一个基因，不要多个基因写在一...[作者空间]
先看曾老师完全用R骚操作的教程，反正我的小本本是带不起来这样的操作的： 搜狗微信搜索，第一篇就是 首先去affy官...[作者空间]
首先访问SRA的提交界面，https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/，在没...[作者空间]
