文章是：Identification of ankylosing spondylitis-associated g...[作者空间]
1. 安装jcvi 可以直接conda安装，记得在python2的环境下哦，3会报错。 2. 准备文件（CDS，p...[作者空间]
我们实验室主要是研究拟南芥的，因此要经常进tair网站，但是有时进的比较慢或者完全打不开，而NCBI也比较慢，所以...[作者空间]
cds文件：注释信息里的蛋白编码序列pep文件：cds对应序列翻译成的氨基酸序列从NCBI上下载基因组时，有的并没...[作者空间]
ka/ks的介绍见之前的文章《一文读懂ka/ks》 ParaAT是中科院基因组所的章张课题组开发的工具，它整合了计...[作者空间]
相见恨晚，还好遇到了它 今天用BLASTX将我的转录本序列在UniProt蛋白数据库(700w条序列)中搜索，80...[作者空间]
前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的...[作者空间]
BLAST本地比对太慢？不怕用diamond 生信入门：序列比对之diamond[作者空间]
介绍 y叔的包，支持GO,KEGG,GSEA等富集分析。同时还整合了gene id转换，富集结果可视化等等功能。 ...[作者空间]
SMART 简介----蛋白序列功能域分析 simple modular architecture researc...[作者空间]
![[NAR|2019] NGPhylogeny.fr一键式进化分析](https://img.haomeiwen.com/is10631927/8bbd229cd505e51e.png)
我们在做多基因分析的时候，有时候会做需要对多个基因进行序列匹配来查看其序列之间的相似性，观察不同基因之间的序列的进...[作者空间]
转自https://www.52pojie.cn/thread-866737-1-1.html 序列分析软件，基本...[作者空间]
关于三个工具的具体描述（尤其GOrilla）,见 GO富集分析-对比Gorilla, clusterProfile...[作者空间]
GOrilla, clusterProfiler, topGO 分析 ranked gene list (GSEA...[作者空间]
介绍 生物信息学研究中，获取基因列表的GO和KEGG富集分析的需求非常常见。目前有许多生物信息学手段或者数据库可以...[作者空间]
FGNet介绍 FGNet（Functional Gene Networks derived from bio...[作者空间]
本菜?甚至是不好意思PO这篇 Tools for manipulating GO and microarrays ...[作者空间]
基因家族生物信息学分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通过基因复制进行物种特异性扩增，主要有染色...[作者空间]
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG...[作者空间]
