目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https:...[作者空间]
bpipe是用于构建分析流程的软件，语法基本与shell一致[bpipe语法详情(http://docs.bpip...[作者空间]
参考 https://zhuanlan.zhihu.com/p/164473497[https://zhuanla...[作者空间]
前言 点阵图（dotplot）作为比较基因组最基础的分析，常用的分析软件有JCVI、mummer等，这里介绍一种新...[作者空间]
写在前面 前两天，推了一篇《简洁 | 优雅地整理 BLAST 比对结果》。其中我大体介绍了四种 BLAST 常用格...[作者空间]
这几天需要做八十多个种的比较基因组，网上找了半天没有提取intron（内含子区）和intergenic regio...[作者空间]
Linux下一切皆文件，对Linux的操作就是对文件的处理。 把最近学习的liunx命令做一个总结，方便复习使用。...[作者空间]
一、常用的特征缩放算法有两种： 归一化(normalization)和标准化(standardization) 二...[作者空间]
上一期，给大家介绍了SnpEff注释数据库。这一期着重介绍SnpEff的命令，最后一期介绍注释结果解析 准备文件已...[作者空间]
写在前面 前述已经提及，接下来会有一系列推文是我的好基友 - 比较基因组小王子 出品。目前，我手上已经拿到系列推文...[作者空间]
写在前面 很久以前，参考NG86计算逻辑提出的文章，我在TBtools中写了Simple Ka/Ks Calcul...[作者空间]
写在前面 比较基因组分析中，常常会使用基因点阵图来查看大体的基因组共线性情况。基于我个人的认知，点阵图可能有几个用...[作者空间]
写在前面 最近我主要在忙两个事情： 了结学校里相关的一些事情，也整理下手上的资料和文件 看看是否有合适的工作 写了...[作者空间]
简介 SyRI，全称Synteny and Rearrangement Identifier，是一个使用 whol...[作者空间]
测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍； 指测序得到的总碱基数（bp）与所测物种基因组大小的...[作者空间]
简要介绍利用eggNOG进行在线注释GO 其原理将query序列与eggNOG编号的蛋白进行多序列比对，确定保守位...[作者空间]
关于基因组组装的流程可以参考我的简书:https://www.jianshu.com/p/e02ecd537c83...[作者空间]
