最近在学习OrthoFinder的过程中,发现了非常不错的分析流程,特向大家分享。[Step-by-Step Or...[作者空间]
1 文件准备 首先准备两个文件,一个是基因的cds序列,一个是蛋白质序列。 cds序列和蛋白质可以在ensembl...[作者空间]
single-copy.list、multi-copy.list等会显示单拷贝多拷贝的orthogroup列表,然...[作者空间]
简介OrthoFinder是用于比较基因组学的快速,准确和全面的平台。 它查找直系群和直系同源物,推断所有直系群的...[作者空间]
OrthoFinder 输出文件说明 OrthoFinder 的标准输出包括:直系同源组,直系同源基因,有根基因树...[作者空间]
OrthoFinder结果文件 运行结束后,在ExampleData里多出一个文件夹,Results_Feb14,...[作者空间]
OrthoMCL介绍 1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性,OrthoMCL能将一组proteins(比...[作者空间]
Orthofinder产生的Orthogroups.GeneCount.tsv不能直接作为CAFE软件的输入文件,...[作者空间]
前言 小编要分享的这篇文章是2020年10月19发表在Nature Communications杂志上,很荣幸...[作者空间]
由OrthoFinder软件可产生大量的分析结果,用于多种分析,下面介绍用产生的文件画系统发育树。 1.基因树(G...[作者空间]
使用单拷贝基因画物种进化树 所需软件: 步骤: python 脚本更改物种蛋白序列的ID 2)更改各个物种蛋白库文...[作者空间]
OrthoFinder结果文件 运行标准OrthoFinder会产生一系列文件:直系同源组、直系同源、基因树、物种...[作者空间]
科研狗对美的追求是永无止境的。为了一张好看的实验结果图,那是赴汤蹈火,在所不惜。下面就跟大家介绍一个美化进化树的...[作者空间]