知识的学习没有一蹴而就，没有捷近，扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文...[作者空间]
3大数据库超2万RNA-seq数据重新统一处理 各种大型计划产出的RNA-seq数据资源已经非常丰富了，但是大家都...[作者空间]
写在前面之一：出于兴趣和知识整理的初衷，写了这篇博文，给网上众多RNA-Seq教程添砖加瓦，也给像我一点一点踩坑的...[作者空间]
放在最前面的话： 由于每次做完文献汇报以后，不久回头去看的时候又是以偷懵逼，于是在此记录文献的内容。 Gene a...[作者空间]
我订阅了近 100 个公众号，有时候想再找之前读过的文章，发现搜索起来特别困难，如果忘了收藏，估计得找半小时，更让...[作者空间]
1 背景 细胞染色体中的基因并不是所有都是活跃表达的，只是只有一部分基因是可以表达，而表达的中间过程就要经历mRN...[作者空间]
原核生物基因结构一个完整的原核基因结构是从基因的5’端启动子区域开始，到3’端终止区域结束。基因的转录开始位置由转...[作者空间]
写在前面 RNA-seq整个流程跑一次，不用理解里面调用包里面的每个命令（这个时候也理解不了） 通过安装包来理解R...[作者空间]
高中学生物的时候关于遗传学的部分，记得当时的教材上为了简化处理一般将基因型定义为AA, Aa, aa。其实这种抽象...[作者空间]
1.Anaconda介绍 你可能已经安装了 Python，那么为什么还需要 Anaconda？有以下3个原因： 1...[作者空间]
1. shell优点 语法和结构通常比较简单 学习和使用通常比较简单 通常不需要编译 适合处理文件和目录之类的对象...[作者空间]
任务 差异基因分析这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也...[作者空间]
作业要求 实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本...[作者空间]
任务 比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2，并且搞懂它的用法。 直接去hi...[作者空间]
作业要求 在UCSC下载hg19参考基因组，从gencode数据库下载基因注释文件，并且用IGV去查看你感兴趣的基...[作者空间]
作业要求 需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试...[作者空间]
转录组入门二，读文献下数据 在NCBI查文章： AKAP95 regulates splicing through...[作者空间]
转录组入门一（mac版） 安装bioconda: 去官网下载和自己电脑系统一样的版本https://conda.i...[作者空间]
