一、 写在前面 2023年4月中旬自己开始做基因家族的分析，对于这块自己没有接触过，因此也是一个挑战，没事！！！（...[作者空间]
论文 https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/20/...[作者空间]
最近在看拟南芥基因组组装相关的论文，想把论文中提到的原始测序数据下载下来，论文中数据获取的部分写道 The raw...[作者空间]
最近研究中遇到个问题，就是翻来覆去似乎并没有找到类似IGV那种看read比对的基于图型泛基因组的基因组浏览器emm...[作者空间]
进化树：进化树在生物学中，用来表示物种之间的进化关系。生物分类学家和进化论者根据各类生物间的亲缘关系的远近，把各类...[作者空间]
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中，可以看出，图片分成2个部分，左边是进化树，右边是类似气泡图。...[作者空间]
论文 The evidence remains clear: SARS-CoV-2 emerged via the...[作者空间]
之前的序列提取教程请看：https://www.jianshu.com/p/211a262aebc4。 之前的基因...[作者空间]
目录 1. 数据处理2. 绘制venn图3. 图表的美化 前段时间看文献的时候，遇到这样一类韦恩图（如下图），我个...[作者空间]
经常有小伙伴问如何绘制下图这样代谢通路与热图的组合图，其中的代谢通路一般都需要经过“简化合并”，而热图一般使用通路...[作者空间]
在《Multi-omics Hammer软件之‘元素索引的批量查找’》推文中我们着重介绍了如何利用大文件的矩阵操作...[作者空间]
前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因...[作者空间]
本节概览：1.GSVA简单介绍2.基因集的下载读取: 手动与msigdbr包下载3.GSVA的运行4.limma差...[作者空间]
基因组的序列提取，详情请看我之前的教程：https://www.jianshu.com/p/211a262aebc...[作者空间]
文末可下载示例数据和代码。 前几天，老师让我画一个这样的图。 粗略一看，似乎没有什么特别困难的地方，好像之前也看到...[作者空间]
找论文的时候偶然发现的这本参考书，个人感觉内容还挺丰富的，在这里推荐给大家 书名是 《Plant Bioinfor...[作者空间]
基本概念： 基因流（也称基因迁移） 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的...[作者空间]
这两天看用vcf文件做单倍型网络的内容，找到了一篇plos one上的论文 论文题目是 A workflow wi...[作者空间]
利用bedtools能够快速批量的提取基因组上指定区域的序列。 1. Example： 文件说明example_g...[作者空间]
