1.背景 单细胞数据分析在进行完细胞自聚类或者细胞类型注释后,一般需要对查到的差异基因可视化,用来显示基因和细胞群...[作者空间]
适用背景 当我们进行跨物种比较分析时会发现基因名对不上,或者找不到基因,这时候就需要进行物种间的同源基因转换。最常...[作者空间]
热图(Heatmap)作为展示基因表达模式最直观的工具。它经常用在分子生物学文章里(尤其是microarray, ...[作者空间]
无论是单细胞、空间组还是ATAC的数据,有时由于下游分析的需求或可视化的需求,同时由于python的运算速度的优势...[作者空间]
在使用Seurat时,经常需要对不同分类的样本在同一画布上进行可视化,可以非常方便地通过其DimPlot()函数的...[作者空间]
关键词 FindTransferAnchors函数 TransferData函数 细胞类型注释 映射数据集/Tra...[作者空间]
这是一般的聚类图 突出显示每个簇的分布展示[作者空间]
实现基于t-SNE坐标,然后用某item的值来体现在颜色上,同时显示基于item值过滤后的密度图 数据集如下: 现...[作者空间]