在国内很多情况下下载国外开发的软件或者国外托管的相关的代码库,依赖和软件包是最耗时最浪费精力的事情。好在国内有不少...[作者空间]
2020-04-13参考文献:A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Str...[作者空间]
单细胞RNA-seq(scRNA-seq)作为一种有前途的技术来表征和分析细胞间的变异性。 然而,技术噪声和固有生...[作者空间]
单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的空前的技术进步现在使以低成本和高通量分析单细胞中全基因组表达成为可能。...[作者空间]
文献解读:Hedlund, E., & Deng, Q. (2018). Single-cell RNA sequ...[作者空间]
文章首发于医信Medchat 11月文献解读:Guerrero-Juarez, C. F., Dedhia, P....[作者空间]
基因集变异分析(GSVA) 软件: GSEAbase GSVA limma Seurat 首先,针对某个细胞类型继...[作者空间]
文章来源:链接胎肝数据再利用:链接数据获取:E-MTAB-7407 胚胎原始血细胞和免疫细胞来源于胚外组织,在受孕...[作者空间]
汤富酬&乔杰组新作。 概述 胚胎植入是哺乳动物胚胎发生过程的里程碑事件,植入失败是流产相当重要的因素之一。鉴于无法...[作者空间]
文献解读 Potter, S. S. (2018).Single-cell RNA sequencing for ...[作者空间]
乳腺上皮细胞(mammary epithelial cells,MECs)结构特征以及发育过程中如何受到调控,对于...[作者空间]
文章发表于nature review genetics:Integrative single- cell anal...[作者空间]
摘要 一文介绍单细胞测序生物信息分析完整流程,这可能是最新也是最全的流程 基础流程(cellranger) cel...[作者空间]
凭借更多元的呼吸器官,两栖动物实现了从水到陆地的“壮举”。 两栖动物是脊椎动物从水到陆的先锋类群。水环境到陆地环境...[作者空间]
Multilineage communication regulates human liver bud deve...[作者空间]
pagoda是2016年在nature methods发表的一个分析单细胞测序的方法,这个包并不是很红火,只是最近...[作者空间]
上期我们讲了使用Seurat分析单个样本,那么2个或多个样本的分析会有哪些不同呢?单细胞转录组数据中一个重要的问题...[作者空间]
刘小泽写于18.12.5变异一般和变异相提并论:遗传是子代重复亲代特征的现象,体现生物的稳定性;变异是指基因组在传...[作者空间]
SOAPdenovo 配置example.config length.pl 计算长度累计曲线perl length...[作者空间]
刘小泽写于18.11.30一般我们得到原始数据、质控过滤后,要么进行比对,要么序列拼接。序列比对的话可以选择参考基...[作者空间]